Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG5

RPRD1B, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1BQ9NQG5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPRD1BQ9NQG5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPRD1BQ9NQG5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPRD1BQ9NQG5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPRD1BQ9NQG5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPRD1BQ9NQG5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPRD1BQ9NQG5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPRD1BQ9NQG5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPRD1BQ9NQG5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPRD1BQ9NQG5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPRD1BQ9NQG5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPRD1BQ9NQG5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RPRD1BQ9NQG5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPRD1BQ9NQG5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPRD1BQ9NQG5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPRD1BQ9NQG5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPRD1BQ9NQG5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPRD1BQ9NQG5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPRD1BQ9NQG5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPRD1BQ9NQG5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPRD1BQ9NQG5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPRD1BQ9NQG5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPRD1BQ9NQG5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPRD1BQ9NQG5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPRD1BQ9NQG5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPRD1BQ9NQG5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPRD1BQ9NQG5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPRD1BQ9NQG5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPRD1BQ9NQG5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPRD1BQ9NQG5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPRD1BQ9NQG5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPRD1BQ9NQG5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPRD1BQ9NQG5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPRD1BQ9NQG5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPRD1BQ9NQG5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPRD1BQ9NQG5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPRD1BQ9NQG5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPRD1BQ9NQG5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RPRD1BQ9NQG5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPRD1BQ9NQG5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPRD1BQ9NQG5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPRD1BQ9NQG5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RPRD1BQ9NQG5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPRD1BQ9NQG5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RPRD1BQ9NQG5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPRD1BQ9NQG5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPRD1BQ9NQG5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPRD1BQ9NQG5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPRD1BQ9NQG5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPRD1BQ9NQG5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPRD1BQ9NQG5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPRD1BQ9NQG5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPRD1BQ9NQG5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPRD1BQ9NQG5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPRD1BQ9NQG5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPRD1BQ9NQG5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RPRD1BQ9NQG5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPRD1BQ9NQG5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPRD1BQ9NQG5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPRD1BQ9NQG5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPRD1BQ9NQG5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPRD1BQ9NQG5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RPRD1BQ9NQG5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPRD1BQ9NQG5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPRD1BQ9NQG5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPRD1BQ9NQG5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPRD1BQ9NQG5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPRD1BQ9NQG5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPRD1BQ9NQG5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPRD1BQ9NQG5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPRD1BQ9NQG5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPRD1BQ9NQG5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RPRD1BQ9NQG5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPRD1BQ9NQG5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPRD1BQ9NQG5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPRD1BQ9NQG5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPRD1BQ9NQG5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPRD1BQ9NQG5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPRD1BQ9NQG5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPRD1BQ9NQG5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPRD1BQ9NQG5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RPRD1BQ9NQG5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RPRD1BQ9NQG5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RPRD1BQ9NQG5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RPRD1BQ9NQG5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RPRD1BQ9NQG5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RPRD1BQ9NQG5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RPRD1BQ9NQG5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RPRD1BQ9NQG5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RPRD1BQ9NQG5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPRD1BQ9NQG5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPRD1BQ9NQG5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPRD1BQ9NQG5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPRD1BQ9NQG5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPRD1BQ9NQG5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPRD1BQ9NQG5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPRD1BQ9NQG5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPRD1BQ9NQG5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPRD1BQ9NQG5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPRD1BQ9NQG5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms