Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA1

KCNMB3, Calcium-activated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB3Q9NPA1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNMB3Q9NPA1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNMB3Q9NPA1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNMB3Q9NPA1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNMB3Q9NPA1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KCNMB3Q9NPA1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KCNMB3Q9NPA1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KCNMB3Q9NPA1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KCNMB3Q9NPA1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KCNMB3Q9NPA1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KCNMB3Q9NPA1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNMB3Q9NPA1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNMB3Q9NPA1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNMB3Q9NPA1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNMB3Q9NPA1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KCNMB3Q9NPA1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KCNMB3Q9NPA1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KCNMB3Q9NPA1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KCNMB3Q9NPA1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KCNMB3Q9NPA1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KCNMB3Q9NPA1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KCNMB3Q9NPA1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KCNMB3Q9NPA1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KCNMB3Q9NPA1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KCNMB3Q9NPA1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KCNMB3Q9NPA1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KCNMB3Q9NPA1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KCNMB3Q9NPA1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KCNMB3Q9NPA1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KCNMB3Q9NPA1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KCNMB3Q9NPA1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KCNMB3Q9NPA1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KCNMB3Q9NPA1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KCNMB3Q9NPA1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KCNMB3Q9NPA1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNMB3Q9NPA1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNMB3Q9NPA1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNMB3Q9NPA1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNMB3Q9NPA1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNMB3Q9NPA1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNMB3Q9NPA1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNMB3Q9NPA1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNMB3Q9NPA1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNMB3Q9NPA1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNMB3Q9NPA1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNMB3Q9NPA1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNMB3Q9NPA1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNMB3Q9NPA1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNMB3Q9NPA1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNMB3Q9NPA1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KCNMB3Q9NPA1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KCNMB3Q9NPA1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KCNMB3Q9NPA1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNMB3Q9NPA1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNMB3Q9NPA1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNMB3Q9NPA1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNMB3Q9NPA1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNMB3Q9NPA1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNMB3Q9NPA1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNMB3Q9NPA1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNMB3Q9NPA1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNMB3Q9NPA1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNMB3Q9NPA1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNMB3Q9NPA1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNMB3Q9NPA1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNMB3Q9NPA1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNMB3Q9NPA1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNMB3Q9NPA1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNMB3Q9NPA1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNMB3Q9NPA1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNMB3Q9NPA1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
KCNMB3Q9NPA1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KCNMB3Q9NPA1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
KCNMB3Q9NPA1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
KCNMB3Q9NPA1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
KCNMB3Q9NPA1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
KCNMB3Q9NPA1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.01
KCNMB3Q9NPA1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNMB3Q9NPA1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNMB3Q9NPA1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNMB3Q9NPA1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNMB3Q9NPA1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNMB3Q9NPA1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNMB3Q9NPA1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNMB3Q9NPA1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNMB3Q9NPA1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNMB3Q9NPA1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNMB3Q9NPA1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNMB3Q9NPA1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNMB3Q9NPA1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNMB3Q9NPA1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNMB3Q9NPA1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNMB3Q9NPA1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNMB3Q9NPA1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNMB3Q9NPA1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNMB3Q9NPA1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNMB3Q9NPA1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNMB3Q9NPA1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNMB3Q9NPA1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNMB3Q9NPA1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.4 ms