Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMG20AQ9NP66 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMG20AQ9NP66 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMG20AQ9NP66 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HMG20AQ9NP66 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HMG20AQ9NP66 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMG20AQ9NP66 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMG20AQ9NP66 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMG20AQ9NP66 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMG20AQ9NP66 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMG20AQ9NP66 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMG20AQ9NP66 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMG20AQ9NP66 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMG20AQ9NP66 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMG20AQ9NP66 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMG20AQ9NP66 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMG20AQ9NP66 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMG20AQ9NP66 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMG20AQ9NP66 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMG20AQ9NP66 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMG20AQ9NP66 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMG20AQ9NP66 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMG20AQ9NP66 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMG20AQ9NP66 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMG20AQ9NP66 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMG20AQ9NP66 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMG20AQ9NP66 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMG20AQ9NP66 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMG20AQ9NP66 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMG20AQ9NP66 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMG20AQ9NP66 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMG20AQ9NP66 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMG20AQ9NP66 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMG20AQ9NP66 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMG20AQ9NP66 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMG20AQ9NP66 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HMG20AQ9NP66 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMG20AQ9NP66 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMG20AQ9NP66 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMG20AQ9NP66 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HMG20AQ9NP66 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMG20AQ9NP66 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HMG20AQ9NP66 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMG20AQ9NP66 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMG20AQ9NP66 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HMG20AQ9NP66 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMG20AQ9NP66 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMG20AQ9NP66 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HMG20AQ9NP66 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMG20AQ9NP66 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMG20AQ9NP66 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMG20AQ9NP66 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HMG20AQ9NP66 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HMG20AQ9NP66 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HMG20AQ9NP66 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMG20AQ9NP66 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMG20AQ9NP66 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMG20AQ9NP66 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMG20AQ9NP66 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMG20AQ9NP66 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HMG20AQ9NP66 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMG20AQ9NP66 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMG20AQ9NP66 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMG20AQ9NP66 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMG20AQ9NP66 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMG20AQ9NP66 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMG20AQ9NP66 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMG20AQ9NP66 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMG20AQ9NP66 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMG20AQ9NP66 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMG20AQ9NP66 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HMG20AQ9NP66 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HMG20AQ9NP66 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HMG20AQ9NP66 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HMG20AQ9NP66 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HMG20AQ9NP66 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HMG20AQ9NP66 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HMG20AQ9NP66 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HMG20AQ9NP66 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HMG20AQ9NP66 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HMG20AQ9NP66 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HMG20AQ9NP66 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HMG20AQ9NP66 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HMG20AQ9NP66 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HMG20AQ9NP66 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HMG20AQ9NP66 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HMG20AQ9NP66 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HMG20AQ9NP66 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HMG20AQ9NP66 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HMG20AQ9NP66 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HMG20AQ9NP66 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HMG20AQ9NP66 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HMG20AQ9NP66 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HMG20AQ9NP66 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HMG20AQ9NP66 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HMG20AQ9NP66 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HMG20AQ9NP66 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HMG20AQ9NP66 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HMG20AQ9NP66 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HMG20AQ9NP66 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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