Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU8

POLD4, DNA polymerase delta subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD4Q9HCU8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLD4Q9HCU8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLD4Q9HCU8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLD4Q9HCU8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLD4Q9HCU8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLD4Q9HCU8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLD4Q9HCU8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLD4Q9HCU8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLD4Q9HCU8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLD4Q9HCU8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLD4Q9HCU8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLD4Q9HCU8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
POLD4Q9HCU8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
POLD4Q9HCU8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLD4Q9HCU8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLD4Q9HCU8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLD4Q9HCU8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLD4Q9HCU8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLD4Q9HCU8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLD4Q9HCU8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLD4Q9HCU8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLD4Q9HCU8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLD4Q9HCU8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLD4Q9HCU8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLD4Q9HCU8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
POLD4Q9HCU8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLD4Q9HCU8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLD4Q9HCU8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLD4Q9HCU8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLD4Q9HCU8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLD4Q9HCU8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLD4Q9HCU8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLD4Q9HCU8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLD4Q9HCU8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
POLD4Q9HCU8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLD4Q9HCU8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLD4Q9HCU8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLD4Q9HCU8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLD4Q9HCU8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLD4Q9HCU8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLD4Q9HCU8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLD4Q9HCU8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLD4Q9HCU8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLD4Q9HCU8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLD4Q9HCU8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLD4Q9HCU8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLD4Q9HCU8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
POLD4Q9HCU8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLD4Q9HCU8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLD4Q9HCU8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLD4Q9HCU8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLD4Q9HCU8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLD4Q9HCU8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLD4Q9HCU8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLD4Q9HCU8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLD4Q9HCU8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLD4Q9HCU8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLD4Q9HCU8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLD4Q9HCU8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLD4Q9HCU8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLD4Q9HCU8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLD4Q9HCU8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLD4Q9HCU8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLD4Q9HCU8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLD4Q9HCU8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLD4Q9HCU8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
POLD4Q9HCU8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
POLD4Q9HCU8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLD4Q9HCU8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLD4Q9HCU8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLD4Q9HCU8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLD4Q9HCU8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLD4Q9HCU8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLD4Q9HCU8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLD4Q9HCU8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLD4Q9HCU8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLD4Q9HCU8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLD4Q9HCU8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLD4Q9HCU8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLD4Q9HCU8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLD4Q9HCU8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLD4Q9HCU8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLD4Q9HCU8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLD4Q9HCU8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLD4Q9HCU8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLD4Q9HCU8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLD4Q9HCU8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLD4Q9HCU8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLD4Q9HCU8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLD4Q9HCU8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLD4Q9HCU8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLD4Q9HCU8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLD4Q9HCU8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLD4Q9HCU8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLD4Q9HCU8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLD4Q9HCU8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLD4Q9HCU8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLD4Q9HCU8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLD4Q9HCU8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLD4Q9HCU8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms