Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW0

BRF2, Transcription factor IIIB 50 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF2Q9HAW0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRF2Q9HAW0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
BRF2Q9HAW0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRF2Q9HAW0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRF2Q9HAW0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRF2Q9HAW0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRF2Q9HAW0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRF2Q9HAW0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BRF2Q9HAW0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRF2Q9HAW0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRF2Q9HAW0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BRF2Q9HAW0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRF2Q9HAW0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRF2Q9HAW0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRF2Q9HAW0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BRF2Q9HAW0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRF2Q9HAW0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRF2Q9HAW0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRF2Q9HAW0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRF2Q9HAW0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRF2Q9HAW0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BRF2Q9HAW0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRF2Q9HAW0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRF2Q9HAW0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRF2Q9HAW0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BRF2Q9HAW0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRF2Q9HAW0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRF2Q9HAW0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRF2Q9HAW0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
BRF2Q9HAW0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BRF2Q9HAW0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRF2Q9HAW0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRF2Q9HAW0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRF2Q9HAW0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRF2Q9HAW0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRF2Q9HAW0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BRF2Q9HAW0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRF2Q9HAW0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRF2Q9HAW0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRF2Q9HAW0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BRF2Q9HAW0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRF2Q9HAW0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRF2Q9HAW0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRF2Q9HAW0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRF2Q9HAW0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRF2Q9HAW0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRF2Q9HAW0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRF2Q9HAW0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
BRF2Q9HAW0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRF2Q9HAW0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRF2Q9HAW0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRF2Q9HAW0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRF2Q9HAW0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRF2Q9HAW0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRF2Q9HAW0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRF2Q9HAW0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRF2Q9HAW0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRF2Q9HAW0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRF2Q9HAW0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRF2Q9HAW0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRF2Q9HAW0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRF2Q9HAW0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRF2Q9HAW0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRF2Q9HAW0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRF2Q9HAW0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRF2Q9HAW0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRF2Q9HAW0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRF2Q9HAW0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BRF2Q9HAW0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRF2Q9HAW0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRF2Q9HAW0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRF2Q9HAW0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRF2Q9HAW0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRF2Q9HAW0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRF2Q9HAW0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRF2Q9HAW0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRF2Q9HAW0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRF2Q9HAW0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRF2Q9HAW0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRF2Q9HAW0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRF2Q9HAW0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRF2Q9HAW0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRF2Q9HAW0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRF2Q9HAW0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRF2Q9HAW0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRF2Q9HAW0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRF2Q9HAW0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRF2Q9HAW0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRF2Q9HAW0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRF2Q9HAW0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRF2Q9HAW0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRF2Q9HAW0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRF2Q9HAW0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRF2Q9HAW0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BRF2Q9HAW0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BRF2Q9HAW0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRF2Q9HAW0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRF2Q9HAW0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BRF2Q9HAW0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRF2Q9HAW0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms