Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BCAS3Q9H6U6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BCAS3Q9H6U6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BCAS3Q9H6U6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BCAS3Q9H6U6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BCAS3Q9H6U6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
BCAS3Q9H6U6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BCAS3Q9H6U6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BCAS3Q9H6U6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BCAS3Q9H6U6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BCAS3Q9H6U6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BCAS3Q9H6U6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BCAS3Q9H6U6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
BCAS3Q9H6U6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
BCAS3Q9H6U6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
BCAS3Q9H6U6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BCAS3Q9H6U6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BCAS3Q9H6U6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BCAS3Q9H6U6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BCAS3Q9H6U6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BCAS3Q9H6U6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
BCAS3Q9H6U6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCAS3Q9H6U6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
BCAS3Q9H6U6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BCAS3Q9H6U6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BCAS3Q9H6U6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BCAS3Q9H6U6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BCAS3Q9H6U6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BCAS3Q9H6U6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BCAS3Q9H6U6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BCAS3Q9H6U6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BCAS3Q9H6U6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BCAS3Q9H6U6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BCAS3Q9H6U6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BCAS3Q9H6U6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BCAS3Q9H6U6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
BCAS3Q9H6U6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BCAS3Q9H6U6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BCAS3Q9H6U6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BCAS3Q9H6U6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BCAS3Q9H6U6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BCAS3Q9H6U6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BCAS3Q9H6U6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BCAS3Q9H6U6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BCAS3Q9H6U6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BCAS3Q9H6U6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BCAS3Q9H6U6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BCAS3Q9H6U6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BCAS3Q9H6U6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BCAS3Q9H6U6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
BCAS3Q9H6U6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BCAS3Q9H6U6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BCAS3Q9H6U6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BCAS3Q9H6U6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BCAS3Q9H6U6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BCAS3Q9H6U6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
BCAS3Q9H6U6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BCAS3Q9H6U6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
BCAS3Q9H6U6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BCAS3Q9H6U6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BCAS3Q9H6U6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BCAS3Q9H6U6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BCAS3Q9H6U6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BCAS3Q9H6U6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BCAS3Q9H6U6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BCAS3Q9H6U6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BCAS3Q9H6U6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BCAS3Q9H6U6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BCAS3Q9H6U6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
BCAS3Q9H6U6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BCAS3Q9H6U6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BCAS3Q9H6U6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BCAS3Q9H6U6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BCAS3Q9H6U6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BCAS3Q9H6U6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BCAS3Q9H6U6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BCAS3Q9H6U6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BCAS3Q9H6U6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BCAS3Q9H6U6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
BCAS3Q9H6U6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BCAS3Q9H6U6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BCAS3Q9H6U6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BCAS3Q9H6U6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BCAS3Q9H6U6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BCAS3Q9H6U6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BCAS3Q9H6U6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BCAS3Q9H6U6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BCAS3Q9H6U6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BCAS3Q9H6U6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BCAS3Q9H6U6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BCAS3Q9H6U6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BCAS3Q9H6U6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BCAS3Q9H6U6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BCAS3Q9H6U6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BCAS3Q9H6U6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BCAS3Q9H6U6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BCAS3Q9H6U6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BCAS3Q9H6U6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BCAS3Q9H6U6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BCAS3Q9H6U6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms