Protein–RNA interactions for Protein: Q9H611

PIF1, ATP-dependent DNA helicase PIF1, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIF1Q9H611 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIF1Q9H611 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIF1Q9H611 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIF1Q9H611 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIF1Q9H611 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIF1Q9H611 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIF1Q9H611 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIF1Q9H611 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIF1Q9H611 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIF1Q9H611 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIF1Q9H611 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIF1Q9H611 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIF1Q9H611 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PIF1Q9H611 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIF1Q9H611 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIF1Q9H611 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIF1Q9H611 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIF1Q9H611 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIF1Q9H611 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIF1Q9H611 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIF1Q9H611 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIF1Q9H611 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIF1Q9H611 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIF1Q9H611 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIF1Q9H611 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIF1Q9H611 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIF1Q9H611 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIF1Q9H611 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIF1Q9H611 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PIF1Q9H611 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIF1Q9H611 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIF1Q9H611 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIF1Q9H611 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIF1Q9H611 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIF1Q9H611 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIF1Q9H611 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIF1Q9H611 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIF1Q9H611 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIF1Q9H611 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIF1Q9H611 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIF1Q9H611 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIF1Q9H611 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIF1Q9H611 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIF1Q9H611 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIF1Q9H611 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIF1Q9H611 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIF1Q9H611 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIF1Q9H611 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIF1Q9H611 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIF1Q9H611 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIF1Q9H611 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PIF1Q9H611 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PIF1Q9H611 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PIF1Q9H611 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIF1Q9H611 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIF1Q9H611 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIF1Q9H611 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIF1Q9H611 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIF1Q9H611 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIF1Q9H611 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIF1Q9H611 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIF1Q9H611 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIF1Q9H611 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIF1Q9H611 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIF1Q9H611 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIF1Q9H611 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIF1Q9H611 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIF1Q9H611 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIF1Q9H611 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIF1Q9H611 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIF1Q9H611 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIF1Q9H611 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIF1Q9H611 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIF1Q9H611 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIF1Q9H611 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIF1Q9H611 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIF1Q9H611 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIF1Q9H611 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIF1Q9H611 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIF1Q9H611 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIF1Q9H611 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIF1Q9H611 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIF1Q9H611 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIF1Q9H611 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PIF1Q9H611 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIF1Q9H611 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PIF1Q9H611 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIF1Q9H611 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIF1Q9H611 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIF1Q9H611 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIF1Q9H611 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIF1Q9H611 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIF1Q9H611 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIF1Q9H611 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIF1Q9H611 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIF1Q9H611 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIF1Q9H611 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIF1Q9H611 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PIF1Q9H611 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIF1Q9H611 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms