Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4P4

RNF41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF41Q9H4P4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RNF41Q9H4P4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RNF41Q9H4P4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RNF41Q9H4P4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RNF41Q9H4P4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RNF41Q9H4P4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RNF41Q9H4P4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RNF41Q9H4P4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RNF41Q9H4P4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RNF41Q9H4P4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RNF41Q9H4P4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RNF41Q9H4P4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RNF41Q9H4P4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
RNF41Q9H4P4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RNF41Q9H4P4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RNF41Q9H4P4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RNF41Q9H4P4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RNF41Q9H4P4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RNF41Q9H4P4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RNF41Q9H4P4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RNF41Q9H4P4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
RNF41Q9H4P4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RNF41Q9H4P4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RNF41Q9H4P4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RNF41Q9H4P4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RNF41Q9H4P4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RNF41Q9H4P4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RNF41Q9H4P4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RNF41Q9H4P4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RNF41Q9H4P4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RNF41Q9H4P4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RNF41Q9H4P4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RNF41Q9H4P4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
RNF41Q9H4P4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RNF41Q9H4P4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RNF41Q9H4P4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
RNF41Q9H4P4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RNF41Q9H4P4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RNF41Q9H4P4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RNF41Q9H4P4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RNF41Q9H4P4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RNF41Q9H4P4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RNF41Q9H4P4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RNF41Q9H4P4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RNF41Q9H4P4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RNF41Q9H4P4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
RNF41Q9H4P4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RNF41Q9H4P4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RNF41Q9H4P4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RNF41Q9H4P4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
RNF41Q9H4P4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF41Q9H4P4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF41Q9H4P4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF41Q9H4P4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF41Q9H4P4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF41Q9H4P4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF41Q9H4P4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RNF41Q9H4P4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RNF41Q9H4P4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RNF41Q9H4P4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RNF41Q9H4P4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RNF41Q9H4P4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RNF41Q9H4P4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RNF41Q9H4P4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RNF41Q9H4P4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RNF41Q9H4P4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RNF41Q9H4P4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RNF41Q9H4P4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RNF41Q9H4P4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF41Q9H4P4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF41Q9H4P4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF41Q9H4P4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF41Q9H4P4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF41Q9H4P4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF41Q9H4P4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF41Q9H4P4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF41Q9H4P4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF41Q9H4P4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RNF41Q9H4P4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RNF41Q9H4P4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RNF41Q9H4P4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RNF41Q9H4P4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RNF41Q9H4P4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RNF41Q9H4P4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RNF41Q9H4P4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RNF41Q9H4P4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
RNF41Q9H4P4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RNF41Q9H4P4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RNF41Q9H4P4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RNF41Q9H4P4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RNF41Q9H4P4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RNF41Q9H4P4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RNF41Q9H4P4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RNF41Q9H4P4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RNF41Q9H4P4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
RNF41Q9H4P4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RNF41Q9H4P4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RNF41Q9H4P4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RNF41Q9H4P4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RNF41Q9H4P4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms