Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3S7

PTPN23, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN23Q9H3S7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
PTPN23Q9H3S7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
PTPN23Q9H3S7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
PTPN23Q9H3S7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
PTPN23Q9H3S7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
PTPN23Q9H3S7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
PTPN23Q9H3S7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
PTPN23Q9H3S7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
PTPN23Q9H3S7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
PTPN23Q9H3S7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
PTPN23Q9H3S7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
PTPN23Q9H3S7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
PTPN23Q9H3S7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
PTPN23Q9H3S7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
PTPN23Q9H3S7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
PTPN23Q9H3S7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
PTPN23Q9H3S7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
PTPN23Q9H3S7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
PTPN23Q9H3S7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
PTPN23Q9H3S7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
PTPN23Q9H3S7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC37.57■■■■□ 3.61
PTPN23Q9H3S7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
PTPN23Q9H3S7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
PTPN23Q9H3S7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
PTPN23Q9H3S7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
PTPN23Q9H3S7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
PTPN23Q9H3S7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
PTPN23Q9H3S7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
PTPN23Q9H3S7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
PTPN23Q9H3S7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
PTPN23Q9H3S7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
PTPN23Q9H3S7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
PTPN23Q9H3S7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
PTPN23Q9H3S7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
PTPN23Q9H3S7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
PTPN23Q9H3S7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.6
PTPN23Q9H3S7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
PTPN23Q9H3S7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
PTPN23Q9H3S7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
PTPN23Q9H3S7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
PTPN23Q9H3S7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
PTPN23Q9H3S7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
PTPN23Q9H3S7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
PTPN23Q9H3S7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
PTPN23Q9H3S7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
PTPN23Q9H3S7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
PTPN23Q9H3S7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
PTPN23Q9H3S7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
PTPN23Q9H3S7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
PTPN23Q9H3S7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
PTPN23Q9H3S7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
PTPN23Q9H3S7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
PTPN23Q9H3S7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
PTPN23Q9H3S7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
PTPN23Q9H3S7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
PTPN23Q9H3S7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
PTPN23Q9H3S7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC37.44■■■■□ 3.58
PTPN23Q9H3S7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
PTPN23Q9H3S7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
PTPN23Q9H3S7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
PTPN23Q9H3S7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC37.43■■■■□ 3.58
PTPN23Q9H3S7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
PTPN23Q9H3S7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
PTPN23Q9H3S7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
PTPN23Q9H3S7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
PTPN23Q9H3S7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
PTPN23Q9H3S7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
PTPN23Q9H3S7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
PTPN23Q9H3S7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.42■■■■□ 3.58
PTPN23Q9H3S7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
PTPN23Q9H3S7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
PTPN23Q9H3S7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
PTPN23Q9H3S7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
PTPN23Q9H3S7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
PTPN23Q9H3S7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
PTPN23Q9H3S7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
PTPN23Q9H3S7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
PTPN23Q9H3S7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.58
PTPN23Q9H3S7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
PTPN23Q9H3S7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
PTPN23Q9H3S7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
PTPN23Q9H3S7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
PTPN23Q9H3S7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PTPN23Q9H3S7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
PTPN23Q9H3S7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
PTPN23Q9H3S7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PTPN23Q9H3S7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PTPN23Q9H3S7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PTPN23Q9H3S7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PTPN23Q9H3S7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
PTPN23Q9H3S7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
PTPN23Q9H3S7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
PTPN23Q9H3S7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
PTPN23Q9H3S7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
PTPN23Q9H3S7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC37.34■■■■□ 3.57
PTPN23Q9H3S7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
PTPN23Q9H3S7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
PTPN23Q9H3S7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
PTPN23Q9H3S7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
PTPN23Q9H3S7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms