Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2F9

CCDC68, Coiled-coil domain-containing protein 68, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC68Q9H2F9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC68Q9H2F9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC68Q9H2F9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC68Q9H2F9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC68Q9H2F9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC68Q9H2F9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC68Q9H2F9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC68Q9H2F9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC68Q9H2F9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC68Q9H2F9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC68Q9H2F9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC68Q9H2F9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC68Q9H2F9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC68Q9H2F9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC68Q9H2F9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC68Q9H2F9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC68Q9H2F9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC68Q9H2F9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC68Q9H2F9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC68Q9H2F9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC68Q9H2F9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC68Q9H2F9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC68Q9H2F9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC68Q9H2F9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC68Q9H2F9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC68Q9H2F9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC68Q9H2F9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC68Q9H2F9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC68Q9H2F9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC68Q9H2F9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC68Q9H2F9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC68Q9H2F9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC68Q9H2F9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC68Q9H2F9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC68Q9H2F9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC68Q9H2F9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC68Q9H2F9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC68Q9H2F9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC68Q9H2F9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC68Q9H2F9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC68Q9H2F9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC68Q9H2F9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC68Q9H2F9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC68Q9H2F9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC68Q9H2F9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC68Q9H2F9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC68Q9H2F9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC68Q9H2F9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC68Q9H2F9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC68Q9H2F9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC68Q9H2F9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC68Q9H2F9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC68Q9H2F9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC68Q9H2F9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC68Q9H2F9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC68Q9H2F9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC68Q9H2F9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC68Q9H2F9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC68Q9H2F9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC68Q9H2F9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC68Q9H2F9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC68Q9H2F9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC68Q9H2F9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC68Q9H2F9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC68Q9H2F9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC68Q9H2F9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC68Q9H2F9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC68Q9H2F9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC68Q9H2F9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC68Q9H2F9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC68Q9H2F9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC68Q9H2F9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC68Q9H2F9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC68Q9H2F9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC68Q9H2F9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC68Q9H2F9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC68Q9H2F9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC68Q9H2F9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC68Q9H2F9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC68Q9H2F9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC68Q9H2F9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC68Q9H2F9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC68Q9H2F9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC68Q9H2F9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC68Q9H2F9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC68Q9H2F9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC68Q9H2F9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC68Q9H2F9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC68Q9H2F9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC68Q9H2F9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC68Q9H2F9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC68Q9H2F9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC68Q9H2F9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC68Q9H2F9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC68Q9H2F9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC68Q9H2F9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC68Q9H2F9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC68Q9H2F9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC68Q9H2F9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC68Q9H2F9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms