Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0Z9

RBM38, RNA-binding protein 38, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM38Q9H0Z9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBM38Q9H0Z9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBM38Q9H0Z9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RBM38Q9H0Z9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RBM38Q9H0Z9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RBM38Q9H0Z9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RBM38Q9H0Z9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBM38Q9H0Z9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBM38Q9H0Z9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBM38Q9H0Z9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBM38Q9H0Z9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBM38Q9H0Z9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBM38Q9H0Z9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBM38Q9H0Z9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBM38Q9H0Z9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBM38Q9H0Z9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBM38Q9H0Z9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBM38Q9H0Z9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBM38Q9H0Z9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBM38Q9H0Z9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBM38Q9H0Z9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBM38Q9H0Z9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBM38Q9H0Z9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBM38Q9H0Z9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBM38Q9H0Z9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBM38Q9H0Z9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBM38Q9H0Z9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RBM38Q9H0Z9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBM38Q9H0Z9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBM38Q9H0Z9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBM38Q9H0Z9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBM38Q9H0Z9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBM38Q9H0Z9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBM38Q9H0Z9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBM38Q9H0Z9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBM38Q9H0Z9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBM38Q9H0Z9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBM38Q9H0Z9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBM38Q9H0Z9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBM38Q9H0Z9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBM38Q9H0Z9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBM38Q9H0Z9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBM38Q9H0Z9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBM38Q9H0Z9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBM38Q9H0Z9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBM38Q9H0Z9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM38Q9H0Z9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM38Q9H0Z9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM38Q9H0Z9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM38Q9H0Z9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM38Q9H0Z9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM38Q9H0Z9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM38Q9H0Z9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM38Q9H0Z9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM38Q9H0Z9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM38Q9H0Z9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM38Q9H0Z9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM38Q9H0Z9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM38Q9H0Z9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM38Q9H0Z9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM38Q9H0Z9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM38Q9H0Z9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM38Q9H0Z9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM38Q9H0Z9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM38Q9H0Z9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM38Q9H0Z9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM38Q9H0Z9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM38Q9H0Z9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBM38Q9H0Z9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBM38Q9H0Z9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBM38Q9H0Z9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBM38Q9H0Z9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBM38Q9H0Z9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM38Q9H0Z9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM38Q9H0Z9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM38Q9H0Z9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM38Q9H0Z9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM38Q9H0Z9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBM38Q9H0Z9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RBM38Q9H0Z9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBM38Q9H0Z9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBM38Q9H0Z9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM38Q9H0Z9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM38Q9H0Z9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM38Q9H0Z9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM38Q9H0Z9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM38Q9H0Z9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBM38Q9H0Z9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM38Q9H0Z9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM38Q9H0Z9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM38Q9H0Z9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM38Q9H0Z9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM38Q9H0Z9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM38Q9H0Z9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM38Q9H0Z9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM38Q9H0Z9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBM38Q9H0Z9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM38Q9H0Z9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM38Q9H0Z9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM38Q9H0Z9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
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