Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD1Q9GZZ0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD1Q9GZZ0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD1Q9GZZ0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD1Q9GZZ0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD1Q9GZZ0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD1Q9GZZ0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD1Q9GZZ0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD1Q9GZZ0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD1Q9GZZ0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD1Q9GZZ0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD1Q9GZZ0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD1Q9GZZ0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD1Q9GZZ0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD1Q9GZZ0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD1Q9GZZ0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD1Q9GZZ0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD1Q9GZZ0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD1Q9GZZ0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD1Q9GZZ0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD1Q9GZZ0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD1Q9GZZ0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD1Q9GZZ0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD1Q9GZZ0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD1Q9GZZ0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD1Q9GZZ0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD1Q9GZZ0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD1Q9GZZ0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD1Q9GZZ0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD1Q9GZZ0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD1Q9GZZ0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD1Q9GZZ0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD1Q9GZZ0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD1Q9GZZ0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD1Q9GZZ0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD1Q9GZZ0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD1Q9GZZ0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD1Q9GZZ0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD1Q9GZZ0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD1Q9GZZ0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD1Q9GZZ0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD1Q9GZZ0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD1Q9GZZ0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD1Q9GZZ0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD1Q9GZZ0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD1Q9GZZ0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD1Q9GZZ0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD1Q9GZZ0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD1Q9GZZ0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD1Q9GZZ0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD1Q9GZZ0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD1Q9GZZ0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD1Q9GZZ0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD1Q9GZZ0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD1Q9GZZ0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD1Q9GZZ0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD1Q9GZZ0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD1Q9GZZ0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD1Q9GZZ0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD1Q9GZZ0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD1Q9GZZ0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD1Q9GZZ0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD1Q9GZZ0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD1Q9GZZ0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD1Q9GZZ0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD1Q9GZZ0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD1Q9GZZ0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD1Q9GZZ0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD1Q9GZZ0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD1Q9GZZ0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD1Q9GZZ0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD1Q9GZZ0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD1Q9GZZ0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXD1Q9GZZ0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXD1Q9GZZ0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD1Q9GZZ0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD1Q9GZZ0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD1Q9GZZ0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD1Q9GZZ0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD1Q9GZZ0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD1Q9GZZ0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD1Q9GZZ0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD1Q9GZZ0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD1Q9GZZ0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD1Q9GZZ0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD1Q9GZZ0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD1Q9GZZ0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD1Q9GZZ0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD1Q9GZZ0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD1Q9GZZ0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD1Q9GZZ0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD1Q9GZZ0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD1Q9GZZ0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD1Q9GZZ0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD1Q9GZZ0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD1Q9GZZ0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD1Q9GZZ0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD1Q9GZZ0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD1Q9GZZ0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD1Q9GZZ0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms