Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZM3

GSX2, GS homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSX2Q9BZM3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GSX2Q9BZM3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSX2Q9BZM3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSX2Q9BZM3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSX2Q9BZM3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSX2Q9BZM3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GSX2Q9BZM3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GSX2Q9BZM3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSX2Q9BZM3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GSX2Q9BZM3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSX2Q9BZM3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSX2Q9BZM3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GSX2Q9BZM3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSX2Q9BZM3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GSX2Q9BZM3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GSX2Q9BZM3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GSX2Q9BZM3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GSX2Q9BZM3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GSX2Q9BZM3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GSX2Q9BZM3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GSX2Q9BZM3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GSX2Q9BZM3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GSX2Q9BZM3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GSX2Q9BZM3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GSX2Q9BZM3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GSX2Q9BZM3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GSX2Q9BZM3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GSX2Q9BZM3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GSX2Q9BZM3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GSX2Q9BZM3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GSX2Q9BZM3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GSX2Q9BZM3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GSX2Q9BZM3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GSX2Q9BZM3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GSX2Q9BZM3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GSX2Q9BZM3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GSX2Q9BZM3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GSX2Q9BZM3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GSX2Q9BZM3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GSX2Q9BZM3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GSX2Q9BZM3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GSX2Q9BZM3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GSX2Q9BZM3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GSX2Q9BZM3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GSX2Q9BZM3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GSX2Q9BZM3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GSX2Q9BZM3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GSX2Q9BZM3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GSX2Q9BZM3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GSX2Q9BZM3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GSX2Q9BZM3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GSX2Q9BZM3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GSX2Q9BZM3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GSX2Q9BZM3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GSX2Q9BZM3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GSX2Q9BZM3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GSX2Q9BZM3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GSX2Q9BZM3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GSX2Q9BZM3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GSX2Q9BZM3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GSX2Q9BZM3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GSX2Q9BZM3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GSX2Q9BZM3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GSX2Q9BZM3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GSX2Q9BZM3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GSX2Q9BZM3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GSX2Q9BZM3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GSX2Q9BZM3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GSX2Q9BZM3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSX2Q9BZM3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSX2Q9BZM3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSX2Q9BZM3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSX2Q9BZM3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSX2Q9BZM3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSX2Q9BZM3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSX2Q9BZM3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSX2Q9BZM3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSX2Q9BZM3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSX2Q9BZM3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSX2Q9BZM3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSX2Q9BZM3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSX2Q9BZM3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GSX2Q9BZM3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GSX2Q9BZM3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GSX2Q9BZM3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GSX2Q9BZM3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GSX2Q9BZM3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GSX2Q9BZM3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GSX2Q9BZM3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GSX2Q9BZM3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GSX2Q9BZM3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GSX2Q9BZM3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GSX2Q9BZM3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GSX2Q9BZM3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GSX2Q9BZM3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GSX2Q9BZM3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GSX2Q9BZM3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GSX2Q9BZM3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GSX2Q9BZM3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GSX2Q9BZM3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms