Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR2

KRTAP4-5, Keratin-associated protein 4-5, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-5Q9BYR2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP4-5Q9BYR2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP4-5Q9BYR2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP4-5Q9BYR2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP4-5Q9BYR2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP4-5Q9BYR2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP4-5Q9BYR2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP4-5Q9BYR2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP4-5Q9BYR2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP4-5Q9BYR2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP4-5Q9BYR2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP4-5Q9BYR2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP4-5Q9BYR2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP4-5Q9BYR2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP4-5Q9BYR2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP4-5Q9BYR2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP4-5Q9BYR2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP4-5Q9BYR2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP4-5Q9BYR2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP4-5Q9BYR2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP4-5Q9BYR2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP4-5Q9BYR2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP4-5Q9BYR2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRTAP4-5Q9BYR2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRTAP4-5Q9BYR2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP4-5Q9BYR2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP4-5Q9BYR2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP4-5Q9BYR2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP4-5Q9BYR2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP4-5Q9BYR2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP4-5Q9BYR2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP4-5Q9BYR2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP4-5Q9BYR2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP4-5Q9BYR2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP4-5Q9BYR2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP4-5Q9BYR2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP4-5Q9BYR2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP4-5Q9BYR2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP4-5Q9BYR2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP4-5Q9BYR2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP4-5Q9BYR2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP4-5Q9BYR2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP4-5Q9BYR2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP4-5Q9BYR2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP4-5Q9BYR2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP4-5Q9BYR2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP4-5Q9BYR2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP4-5Q9BYR2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP4-5Q9BYR2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP4-5Q9BYR2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP4-5Q9BYR2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP4-5Q9BYR2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP4-5Q9BYR2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP4-5Q9BYR2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP4-5Q9BYR2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP4-5Q9BYR2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP4-5Q9BYR2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP4-5Q9BYR2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP4-5Q9BYR2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP4-5Q9BYR2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP4-5Q9BYR2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP4-5Q9BYR2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP4-5Q9BYR2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KRTAP4-5Q9BYR2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP4-5Q9BYR2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP4-5Q9BYR2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP4-5Q9BYR2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP4-5Q9BYR2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP4-5Q9BYR2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP4-5Q9BYR2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP4-5Q9BYR2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP4-5Q9BYR2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP4-5Q9BYR2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP4-5Q9BYR2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP4-5Q9BYR2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP4-5Q9BYR2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP4-5Q9BYR2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP4-5Q9BYR2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP4-5Q9BYR2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP4-5Q9BYR2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP4-5Q9BYR2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP4-5Q9BYR2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP4-5Q9BYR2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP4-5Q9BYR2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP4-5Q9BYR2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP4-5Q9BYR2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP4-5Q9BYR2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP4-5Q9BYR2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP4-5Q9BYR2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP4-5Q9BYR2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP4-5Q9BYR2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP4-5Q9BYR2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP4-5Q9BYR2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP4-5Q9BYR2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP4-5Q9BYR2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP4-5Q9BYR2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP4-5Q9BYR2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP4-5Q9BYR2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP4-5Q9BYR2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP4-5Q9BYR2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms