Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXU9

CALN1, Calcium-binding protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALN1Q9BXU9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CALN1Q9BXU9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CALN1Q9BXU9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CALN1Q9BXU9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CALN1Q9BXU9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CALN1Q9BXU9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CALN1Q9BXU9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CALN1Q9BXU9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CALN1Q9BXU9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CALN1Q9BXU9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CALN1Q9BXU9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CALN1Q9BXU9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALN1Q9BXU9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALN1Q9BXU9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALN1Q9BXU9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALN1Q9BXU9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALN1Q9BXU9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALN1Q9BXU9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALN1Q9BXU9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALN1Q9BXU9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALN1Q9BXU9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALN1Q9BXU9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALN1Q9BXU9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALN1Q9BXU9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALN1Q9BXU9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALN1Q9BXU9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALN1Q9BXU9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALN1Q9BXU9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALN1Q9BXU9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALN1Q9BXU9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALN1Q9BXU9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALN1Q9BXU9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALN1Q9BXU9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALN1Q9BXU9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALN1Q9BXU9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALN1Q9BXU9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALN1Q9BXU9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALN1Q9BXU9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALN1Q9BXU9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALN1Q9BXU9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALN1Q9BXU9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALN1Q9BXU9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALN1Q9BXU9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
CALN1Q9BXU9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CALN1Q9BXU9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CALN1Q9BXU9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CALN1Q9BXU9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CALN1Q9BXU9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALN1Q9BXU9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALN1Q9BXU9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALN1Q9BXU9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALN1Q9BXU9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CALN1Q9BXU9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALN1Q9BXU9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CALN1Q9BXU9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CALN1Q9BXU9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CALN1Q9BXU9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALN1Q9BXU9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALN1Q9BXU9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALN1Q9BXU9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALN1Q9BXU9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALN1Q9BXU9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALN1Q9BXU9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185.7 ms