Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXM7

PINK1, Serine/threonine-protein kinase PINK1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PINK1Q9BXM7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PINK1Q9BXM7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PINK1Q9BXM7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PINK1Q9BXM7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PINK1Q9BXM7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PINK1Q9BXM7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PINK1Q9BXM7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PINK1Q9BXM7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PINK1Q9BXM7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PINK1Q9BXM7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PINK1Q9BXM7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PINK1Q9BXM7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PINK1Q9BXM7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PINK1Q9BXM7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PINK1Q9BXM7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PINK1Q9BXM7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PINK1Q9BXM7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PINK1Q9BXM7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PINK1Q9BXM7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PINK1Q9BXM7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PINK1Q9BXM7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PINK1Q9BXM7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PINK1Q9BXM7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PINK1Q9BXM7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PINK1Q9BXM7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PINK1Q9BXM7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PINK1Q9BXM7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PINK1Q9BXM7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PINK1Q9BXM7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PINK1Q9BXM7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PINK1Q9BXM7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PINK1Q9BXM7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PINK1Q9BXM7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PINK1Q9BXM7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PINK1Q9BXM7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PINK1Q9BXM7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PINK1Q9BXM7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PINK1Q9BXM7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PINK1Q9BXM7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PINK1Q9BXM7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PINK1Q9BXM7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PINK1Q9BXM7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PINK1Q9BXM7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PINK1Q9BXM7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PINK1Q9BXM7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PINK1Q9BXM7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PINK1Q9BXM7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PINK1Q9BXM7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PINK1Q9BXM7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PINK1Q9BXM7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PINK1Q9BXM7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PINK1Q9BXM7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PINK1Q9BXM7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PINK1Q9BXM7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PINK1Q9BXM7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PINK1Q9BXM7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PINK1Q9BXM7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PINK1Q9BXM7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PINK1Q9BXM7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PINK1Q9BXM7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PINK1Q9BXM7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PINK1Q9BXM7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PINK1Q9BXM7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PINK1Q9BXM7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PINK1Q9BXM7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PINK1Q9BXM7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PINK1Q9BXM7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PINK1Q9BXM7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PINK1Q9BXM7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PINK1Q9BXM7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PINK1Q9BXM7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PINK1Q9BXM7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PINK1Q9BXM7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PINK1Q9BXM7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PINK1Q9BXM7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PINK1Q9BXM7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PINK1Q9BXM7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PINK1Q9BXM7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PINK1Q9BXM7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PINK1Q9BXM7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PINK1Q9BXM7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PINK1Q9BXM7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PINK1Q9BXM7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PINK1Q9BXM7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PINK1Q9BXM7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PINK1Q9BXM7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PINK1Q9BXM7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PINK1Q9BXM7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PINK1Q9BXM7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PINK1Q9BXM7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PINK1Q9BXM7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PINK1Q9BXM7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PINK1Q9BXM7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PINK1Q9BXM7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PINK1Q9BXM7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PINK1Q9BXM7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PINK1Q9BXM7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PINK1Q9BXM7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PINK1Q9BXM7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PINK1Q9BXM7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms