Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWQ6

YIPF2, Protein YIPF2, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF2Q9BWQ6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YIPF2Q9BWQ6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
YIPF2Q9BWQ6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YIPF2Q9BWQ6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YIPF2Q9BWQ6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YIPF2Q9BWQ6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
YIPF2Q9BWQ6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
YIPF2Q9BWQ6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YIPF2Q9BWQ6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YIPF2Q9BWQ6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
YIPF2Q9BWQ6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YIPF2Q9BWQ6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YIPF2Q9BWQ6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
YIPF2Q9BWQ6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YIPF2Q9BWQ6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YIPF2Q9BWQ6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YIPF2Q9BWQ6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
YIPF2Q9BWQ6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YIPF2Q9BWQ6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YIPF2Q9BWQ6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YIPF2Q9BWQ6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YIPF2Q9BWQ6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YIPF2Q9BWQ6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YIPF2Q9BWQ6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YIPF2Q9BWQ6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YIPF2Q9BWQ6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
YIPF2Q9BWQ6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
YIPF2Q9BWQ6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YIPF2Q9BWQ6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
YIPF2Q9BWQ6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YIPF2Q9BWQ6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
YIPF2Q9BWQ6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YIPF2Q9BWQ6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YIPF2Q9BWQ6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YIPF2Q9BWQ6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YIPF2Q9BWQ6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
YIPF2Q9BWQ6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YIPF2Q9BWQ6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YIPF2Q9BWQ6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
YIPF2Q9BWQ6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YIPF2Q9BWQ6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
YIPF2Q9BWQ6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
YIPF2Q9BWQ6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YIPF2Q9BWQ6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
YIPF2Q9BWQ6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YIPF2Q9BWQ6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
YIPF2Q9BWQ6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YIPF2Q9BWQ6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YIPF2Q9BWQ6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YIPF2Q9BWQ6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
YIPF2Q9BWQ6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YIPF2Q9BWQ6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YIPF2Q9BWQ6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
YIPF2Q9BWQ6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
YIPF2Q9BWQ6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
YIPF2Q9BWQ6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YIPF2Q9BWQ6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
YIPF2Q9BWQ6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
YIPF2Q9BWQ6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
YIPF2Q9BWQ6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
YIPF2Q9BWQ6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
YIPF2Q9BWQ6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
YIPF2Q9BWQ6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
YIPF2Q9BWQ6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
YIPF2Q9BWQ6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
YIPF2Q9BWQ6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
YIPF2Q9BWQ6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
YIPF2Q9BWQ6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YIPF2Q9BWQ6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YIPF2Q9BWQ6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YIPF2Q9BWQ6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YIPF2Q9BWQ6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
YIPF2Q9BWQ6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
YIPF2Q9BWQ6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
YIPF2Q9BWQ6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
YIPF2Q9BWQ6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
YIPF2Q9BWQ6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
YIPF2Q9BWQ6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
YIPF2Q9BWQ6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
YIPF2Q9BWQ6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
YIPF2Q9BWQ6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
YIPF2Q9BWQ6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
YIPF2Q9BWQ6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
YIPF2Q9BWQ6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
YIPF2Q9BWQ6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YIPF2Q9BWQ6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
YIPF2Q9BWQ6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
YIPF2Q9BWQ6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
YIPF2Q9BWQ6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YIPF2Q9BWQ6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
YIPF2Q9BWQ6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
YIPF2Q9BWQ6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
YIPF2Q9BWQ6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
YIPF2Q9BWQ6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
YIPF2Q9BWQ6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
YIPF2Q9BWQ6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
YIPF2Q9BWQ6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
YIPF2Q9BWQ6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
YIPF2Q9BWQ6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
YIPF2Q9BWQ6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms