Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT27Q9BW83 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT27Q9BW83 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT27Q9BW83 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT27Q9BW83 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT27Q9BW83 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT27Q9BW83 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT27Q9BW83 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT27Q9BW83 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT27Q9BW83 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT27Q9BW83 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT27Q9BW83 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT27Q9BW83 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT27Q9BW83 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT27Q9BW83 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT27Q9BW83 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT27Q9BW83 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT27Q9BW83 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT27Q9BW83 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT27Q9BW83 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT27Q9BW83 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT27Q9BW83 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT27Q9BW83 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT27Q9BW83 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT27Q9BW83 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT27Q9BW83 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT27Q9BW83 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT27Q9BW83 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT27Q9BW83 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT27Q9BW83 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT27Q9BW83 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT27Q9BW83 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT27Q9BW83 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT27Q9BW83 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT27Q9BW83 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT27Q9BW83 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT27Q9BW83 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT27Q9BW83 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFT27Q9BW83 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFT27Q9BW83 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFT27Q9BW83 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFT27Q9BW83 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFT27Q9BW83 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFT27Q9BW83 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFT27Q9BW83 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFT27Q9BW83 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT27Q9BW83 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT27Q9BW83 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT27Q9BW83 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT27Q9BW83 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT27Q9BW83 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT27Q9BW83 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT27Q9BW83 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT27Q9BW83 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT27Q9BW83 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT27Q9BW83 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT27Q9BW83 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT27Q9BW83 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT27Q9BW83 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT27Q9BW83 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT27Q9BW83 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT27Q9BW83 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT27Q9BW83 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT27Q9BW83 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT27Q9BW83 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT27Q9BW83 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT27Q9BW83 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT27Q9BW83 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT27Q9BW83 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT27Q9BW83 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFT27Q9BW83 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT27Q9BW83 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT27Q9BW83 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT27Q9BW83 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT27Q9BW83 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT27Q9BW83 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT27Q9BW83 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT27Q9BW83 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT27Q9BW83 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFT27Q9BW83 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT27Q9BW83 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT27Q9BW83 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT27Q9BW83 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT27Q9BW83 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT27Q9BW83 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT27Q9BW83 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT27Q9BW83 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFT27Q9BW83 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT27Q9BW83 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT27Q9BW83 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT27Q9BW83 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT27Q9BW83 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFT27Q9BW83 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT27Q9BW83 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT27Q9BW83 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT27Q9BW83 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT27Q9BW83 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT27Q9BW83 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFT27Q9BW83 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFT27Q9BW83 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
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