Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPS4Q9BT78 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPS4Q9BT78 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPS4Q9BT78 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPS4Q9BT78 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPS4Q9BT78 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPS4Q9BT78 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPS4Q9BT78 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPS4Q9BT78 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
COPS4Q9BT78 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
COPS4Q9BT78 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPS4Q9BT78 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPS4Q9BT78 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPS4Q9BT78 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPS4Q9BT78 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
COPS4Q9BT78 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPS4Q9BT78 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPS4Q9BT78 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPS4Q9BT78 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPS4Q9BT78 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPS4Q9BT78 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
COPS4Q9BT78 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPS4Q9BT78 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPS4Q9BT78 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPS4Q9BT78 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPS4Q9BT78 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPS4Q9BT78 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPS4Q9BT78 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPS4Q9BT78 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPS4Q9BT78 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPS4Q9BT78 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPS4Q9BT78 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPS4Q9BT78 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPS4Q9BT78 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPS4Q9BT78 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPS4Q9BT78 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPS4Q9BT78 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPS4Q9BT78 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPS4Q9BT78 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPS4Q9BT78 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPS4Q9BT78 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPS4Q9BT78 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPS4Q9BT78 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPS4Q9BT78 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPS4Q9BT78 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPS4Q9BT78 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPS4Q9BT78 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPS4Q9BT78 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
COPS4Q9BT78 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPS4Q9BT78 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPS4Q9BT78 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPS4Q9BT78 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPS4Q9BT78 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPS4Q9BT78 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPS4Q9BT78 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPS4Q9BT78 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPS4Q9BT78 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPS4Q9BT78 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
COPS4Q9BT78 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPS4Q9BT78 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPS4Q9BT78 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPS4Q9BT78 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPS4Q9BT78 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPS4Q9BT78 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPS4Q9BT78 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPS4Q9BT78 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPS4Q9BT78 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPS4Q9BT78 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPS4Q9BT78 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPS4Q9BT78 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPS4Q9BT78 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPS4Q9BT78 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPS4Q9BT78 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPS4Q9BT78 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPS4Q9BT78 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPS4Q9BT78 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPS4Q9BT78 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPS4Q9BT78 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPS4Q9BT78 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPS4Q9BT78 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPS4Q9BT78 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPS4Q9BT78 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPS4Q9BT78 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPS4Q9BT78 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPS4Q9BT78 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPS4Q9BT78 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPS4Q9BT78 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPS4Q9BT78 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPS4Q9BT78 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPS4Q9BT78 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPS4Q9BT78 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPS4Q9BT78 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPS4Q9BT78 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPS4Q9BT78 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPS4Q9BT78 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPS4Q9BT78 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPS4Q9BT78 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPS4Q9BT78 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPS4Q9BT78 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPS4Q9BT78 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms