Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK0

REEP2, Receptor expression-enhancing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP2Q9BRK0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
REEP2Q9BRK0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
REEP2Q9BRK0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
REEP2Q9BRK0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
REEP2Q9BRK0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
REEP2Q9BRK0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
REEP2Q9BRK0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
REEP2Q9BRK0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
REEP2Q9BRK0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
REEP2Q9BRK0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
REEP2Q9BRK0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
REEP2Q9BRK0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
REEP2Q9BRK0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
REEP2Q9BRK0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
REEP2Q9BRK0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
REEP2Q9BRK0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
REEP2Q9BRK0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
REEP2Q9BRK0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
REEP2Q9BRK0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
REEP2Q9BRK0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
REEP2Q9BRK0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
REEP2Q9BRK0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
REEP2Q9BRK0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
REEP2Q9BRK0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
REEP2Q9BRK0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
REEP2Q9BRK0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
REEP2Q9BRK0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
REEP2Q9BRK0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
REEP2Q9BRK0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
REEP2Q9BRK0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
REEP2Q9BRK0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
REEP2Q9BRK0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
REEP2Q9BRK0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
REEP2Q9BRK0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
REEP2Q9BRK0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
REEP2Q9BRK0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
REEP2Q9BRK0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
REEP2Q9BRK0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
REEP2Q9BRK0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
REEP2Q9BRK0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
REEP2Q9BRK0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
REEP2Q9BRK0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
REEP2Q9BRK0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
REEP2Q9BRK0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
REEP2Q9BRK0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
REEP2Q9BRK0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
REEP2Q9BRK0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
REEP2Q9BRK0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
REEP2Q9BRK0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
REEP2Q9BRK0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
REEP2Q9BRK0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
REEP2Q9BRK0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
REEP2Q9BRK0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
REEP2Q9BRK0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
REEP2Q9BRK0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
REEP2Q9BRK0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
REEP2Q9BRK0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
REEP2Q9BRK0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
REEP2Q9BRK0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
REEP2Q9BRK0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
REEP2Q9BRK0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
REEP2Q9BRK0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
REEP2Q9BRK0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
REEP2Q9BRK0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
REEP2Q9BRK0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
REEP2Q9BRK0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
REEP2Q9BRK0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
REEP2Q9BRK0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
REEP2Q9BRK0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
REEP2Q9BRK0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
REEP2Q9BRK0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
REEP2Q9BRK0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
REEP2Q9BRK0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
REEP2Q9BRK0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
REEP2Q9BRK0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
REEP2Q9BRK0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
REEP2Q9BRK0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
REEP2Q9BRK0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
REEP2Q9BRK0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
REEP2Q9BRK0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
REEP2Q9BRK0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
REEP2Q9BRK0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
REEP2Q9BRK0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
REEP2Q9BRK0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
REEP2Q9BRK0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
REEP2Q9BRK0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
REEP2Q9BRK0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
REEP2Q9BRK0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
REEP2Q9BRK0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
REEP2Q9BRK0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
REEP2Q9BRK0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
REEP2Q9BRK0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
REEP2Q9BRK0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
REEP2Q9BRK0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
REEP2Q9BRK0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
REEP2Q9BRK0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
REEP2Q9BRK0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
REEP2Q9BRK0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
REEP2Q9BRK0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
REEP2Q9BRK0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms