Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF559Q9BR84 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF559Q9BR84 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF559Q9BR84 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF559Q9BR84 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF559Q9BR84 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF559Q9BR84 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF559Q9BR84 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF559Q9BR84 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF559Q9BR84 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF559Q9BR84 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF559Q9BR84 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF559Q9BR84 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF559Q9BR84 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF559Q9BR84 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF559Q9BR84 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF559Q9BR84 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF559Q9BR84 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF559Q9BR84 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF559Q9BR84 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF559Q9BR84 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF559Q9BR84 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF559Q9BR84 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF559Q9BR84 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF559Q9BR84 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF559Q9BR84 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF559Q9BR84 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF559Q9BR84 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF559Q9BR84 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF559Q9BR84 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF559Q9BR84 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF559Q9BR84 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF559Q9BR84 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF559Q9BR84 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF559Q9BR84 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF559Q9BR84 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF559Q9BR84 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF559Q9BR84 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF559Q9BR84 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF559Q9BR84 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF559Q9BR84 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF559Q9BR84 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF559Q9BR84 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF559Q9BR84 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF559Q9BR84 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF559Q9BR84 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF559Q9BR84 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF559Q9BR84 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF559Q9BR84 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF559Q9BR84 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF559Q9BR84 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF559Q9BR84 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF559Q9BR84 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF559Q9BR84 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF559Q9BR84 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF559Q9BR84 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF559Q9BR84 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF559Q9BR84 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF559Q9BR84 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF559Q9BR84 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF559Q9BR84 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF559Q9BR84 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF559Q9BR84 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF559Q9BR84 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF559Q9BR84 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF559Q9BR84 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF559Q9BR84 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF559Q9BR84 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF559Q9BR84 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF559Q9BR84 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF559Q9BR84 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF559Q9BR84 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF559Q9BR84 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF559Q9BR84 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF559Q9BR84 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF559Q9BR84 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF559Q9BR84 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF559Q9BR84 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF559Q9BR84 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF559Q9BR84 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF559Q9BR84 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF559Q9BR84 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF559Q9BR84 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF559Q9BR84 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF559Q9BR84 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF559Q9BR84 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF559Q9BR84 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF559Q9BR84 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF559Q9BR84 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF559Q9BR84 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF559Q9BR84 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF559Q9BR84 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF559Q9BR84 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF559Q9BR84 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF559Q9BR84 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF559Q9BR84 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF559Q9BR84 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF559Q9BR84 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF559Q9BR84 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF559Q9BR84 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.1 ms