Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ83

SLX1A, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX1AQ9BQ83 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLX1AQ9BQ83 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLX1AQ9BQ83 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLX1AQ9BQ83 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLX1AQ9BQ83 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLX1AQ9BQ83 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLX1AQ9BQ83 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLX1AQ9BQ83 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLX1AQ9BQ83 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLX1AQ9BQ83 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLX1AQ9BQ83 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLX1AQ9BQ83 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLX1AQ9BQ83 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLX1AQ9BQ83 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLX1AQ9BQ83 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLX1AQ9BQ83 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLX1AQ9BQ83 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLX1AQ9BQ83 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLX1AQ9BQ83 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLX1AQ9BQ83 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLX1AQ9BQ83 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLX1AQ9BQ83 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLX1AQ9BQ83 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLX1AQ9BQ83 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLX1AQ9BQ83 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLX1AQ9BQ83 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLX1AQ9BQ83 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLX1AQ9BQ83 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLX1AQ9BQ83 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLX1AQ9BQ83 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLX1AQ9BQ83 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLX1AQ9BQ83 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLX1AQ9BQ83 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLX1AQ9BQ83 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLX1AQ9BQ83 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLX1AQ9BQ83 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLX1AQ9BQ83 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLX1AQ9BQ83 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLX1AQ9BQ83 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLX1AQ9BQ83 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLX1AQ9BQ83 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLX1AQ9BQ83 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLX1AQ9BQ83 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLX1AQ9BQ83 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLX1AQ9BQ83 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLX1AQ9BQ83 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLX1AQ9BQ83 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLX1AQ9BQ83 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLX1AQ9BQ83 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLX1AQ9BQ83 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLX1AQ9BQ83 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLX1AQ9BQ83 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLX1AQ9BQ83 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLX1AQ9BQ83 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLX1AQ9BQ83 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLX1AQ9BQ83 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLX1AQ9BQ83 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLX1AQ9BQ83 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLX1AQ9BQ83 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLX1AQ9BQ83 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLX1AQ9BQ83 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLX1AQ9BQ83 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLX1AQ9BQ83 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLX1AQ9BQ83 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLX1AQ9BQ83 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLX1AQ9BQ83 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SLX1AQ9BQ83 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLX1AQ9BQ83 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLX1AQ9BQ83 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLX1AQ9BQ83 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLX1AQ9BQ83 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLX1AQ9BQ83 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLX1AQ9BQ83 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLX1AQ9BQ83 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLX1AQ9BQ83 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLX1AQ9BQ83 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLX1AQ9BQ83 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLX1AQ9BQ83 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLX1AQ9BQ83 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLX1AQ9BQ83 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLX1AQ9BQ83 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLX1AQ9BQ83 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLX1AQ9BQ83 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLX1AQ9BQ83 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLX1AQ9BQ83 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLX1AQ9BQ83 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLX1AQ9BQ83 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLX1AQ9BQ83 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLX1AQ9BQ83 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLX1AQ9BQ83 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLX1AQ9BQ83 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLX1AQ9BQ83 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLX1AQ9BQ83 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLX1AQ9BQ83 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLX1AQ9BQ83 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLX1AQ9BQ83 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLX1AQ9BQ83 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLX1AQ9BQ83 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLX1AQ9BQ83 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLX1AQ9BQ83 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms