Protein–RNA interactions for Protein: Q99999

GAL3ST1, Galactosylceramide sulfotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST1Q99999 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GAL3ST1Q99999 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GAL3ST1Q99999 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GAL3ST1Q99999 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GAL3ST1Q99999 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GAL3ST1Q99999 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GAL3ST1Q99999 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GAL3ST1Q99999 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GAL3ST1Q99999 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GAL3ST1Q99999 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
GAL3ST1Q99999 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GAL3ST1Q99999 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GAL3ST1Q99999 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GAL3ST1Q99999 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GAL3ST1Q99999 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GAL3ST1Q99999 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GAL3ST1Q99999 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GAL3ST1Q99999 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GAL3ST1Q99999 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GAL3ST1Q99999 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GAL3ST1Q99999 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GAL3ST1Q99999 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GAL3ST1Q99999 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GAL3ST1Q99999 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GAL3ST1Q99999 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GAL3ST1Q99999 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GAL3ST1Q99999 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GAL3ST1Q99999 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GAL3ST1Q99999 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GAL3ST1Q99999 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GAL3ST1Q99999 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GAL3ST1Q99999 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GAL3ST1Q99999 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GAL3ST1Q99999 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GAL3ST1Q99999 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GAL3ST1Q99999 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GAL3ST1Q99999 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GAL3ST1Q99999 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GAL3ST1Q99999 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GAL3ST1Q99999 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GAL3ST1Q99999 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GAL3ST1Q99999 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GAL3ST1Q99999 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GAL3ST1Q99999 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GAL3ST1Q99999 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GAL3ST1Q99999 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GAL3ST1Q99999 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GAL3ST1Q99999 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GAL3ST1Q99999 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GAL3ST1Q99999 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GAL3ST1Q99999 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GAL3ST1Q99999 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GAL3ST1Q99999 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GAL3ST1Q99999 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GAL3ST1Q99999 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GAL3ST1Q99999 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GAL3ST1Q99999 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GAL3ST1Q99999 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GAL3ST1Q99999 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GAL3ST1Q99999 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GAL3ST1Q99999 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GAL3ST1Q99999 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GAL3ST1Q99999 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GAL3ST1Q99999 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GAL3ST1Q99999 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GAL3ST1Q99999 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GAL3ST1Q99999 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GAL3ST1Q99999 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GAL3ST1Q99999 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GAL3ST1Q99999 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GAL3ST1Q99999 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GAL3ST1Q99999 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GAL3ST1Q99999 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GAL3ST1Q99999 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GAL3ST1Q99999 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GAL3ST1Q99999 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GAL3ST1Q99999 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GAL3ST1Q99999 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GAL3ST1Q99999 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GAL3ST1Q99999 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GAL3ST1Q99999 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GAL3ST1Q99999 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GAL3ST1Q99999 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GAL3ST1Q99999 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GAL3ST1Q99999 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GAL3ST1Q99999 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GAL3ST1Q99999 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GAL3ST1Q99999 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GAL3ST1Q99999 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GAL3ST1Q99999 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GAL3ST1Q99999 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GAL3ST1Q99999 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GAL3ST1Q99999 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GAL3ST1Q99999 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GAL3ST1Q99999 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GAL3ST1Q99999 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GAL3ST1Q99999 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GAL3ST1Q99999 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GAL3ST1Q99999 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GAL3ST1Q99999 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms