Protein–RNA interactions for Protein: Q99788

CMKLR1, Chemokine-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMKLR1Q99788 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CMKLR1Q99788 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CMKLR1Q99788 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CMKLR1Q99788 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CMKLR1Q99788 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CMKLR1Q99788 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CMKLR1Q99788 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CMKLR1Q99788 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CMKLR1Q99788 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CMKLR1Q99788 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CMKLR1Q99788 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CMKLR1Q99788 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CMKLR1Q99788 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CMKLR1Q99788 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CMKLR1Q99788 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CMKLR1Q99788 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CMKLR1Q99788 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CMKLR1Q99788 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CMKLR1Q99788 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CMKLR1Q99788 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CMKLR1Q99788 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CMKLR1Q99788 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CMKLR1Q99788 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CMKLR1Q99788 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CMKLR1Q99788 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CMKLR1Q99788 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CMKLR1Q99788 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CMKLR1Q99788 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CMKLR1Q99788 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CMKLR1Q99788 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CMKLR1Q99788 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CMKLR1Q99788 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CMKLR1Q99788 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CMKLR1Q99788 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CMKLR1Q99788 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CMKLR1Q99788 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CMKLR1Q99788 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CMKLR1Q99788 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CMKLR1Q99788 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CMKLR1Q99788 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CMKLR1Q99788 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CMKLR1Q99788 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CMKLR1Q99788 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CMKLR1Q99788 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CMKLR1Q99788 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CMKLR1Q99788 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CMKLR1Q99788 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CMKLR1Q99788 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CMKLR1Q99788 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CMKLR1Q99788 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CMKLR1Q99788 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CMKLR1Q99788 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CMKLR1Q99788 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CMKLR1Q99788 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CMKLR1Q99788 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CMKLR1Q99788 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CMKLR1Q99788 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CMKLR1Q99788 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CMKLR1Q99788 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CMKLR1Q99788 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CMKLR1Q99788 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CMKLR1Q99788 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CMKLR1Q99788 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CMKLR1Q99788 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CMKLR1Q99788 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CMKLR1Q99788 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CMKLR1Q99788 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CMKLR1Q99788 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CMKLR1Q99788 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CMKLR1Q99788 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CMKLR1Q99788 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CMKLR1Q99788 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CMKLR1Q99788 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CMKLR1Q99788 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CMKLR1Q99788 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CMKLR1Q99788 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CMKLR1Q99788 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CMKLR1Q99788 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CMKLR1Q99788 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CMKLR1Q99788 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CMKLR1Q99788 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CMKLR1Q99788 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CMKLR1Q99788 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CMKLR1Q99788 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CMKLR1Q99788 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CMKLR1Q99788 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CMKLR1Q99788 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CMKLR1Q99788 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CMKLR1Q99788 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CMKLR1Q99788 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CMKLR1Q99788 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CMKLR1Q99788 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CMKLR1Q99788 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CMKLR1Q99788 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CMKLR1Q99788 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CMKLR1Q99788 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CMKLR1Q99788 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CMKLR1Q99788 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CMKLR1Q99788 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CMKLR1Q99788 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms