Protein–RNA interactions for Protein: Q99741

CDC6, Cell division control protein 6 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC6Q99741 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC6Q99741 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC6Q99741 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC6Q99741 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC6Q99741 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC6Q99741 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC6Q99741 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC6Q99741 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC6Q99741 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC6Q99741 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC6Q99741 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC6Q99741 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC6Q99741 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC6Q99741 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC6Q99741 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC6Q99741 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDC6Q99741 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC6Q99741 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC6Q99741 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC6Q99741 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC6Q99741 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC6Q99741 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC6Q99741 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC6Q99741 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC6Q99741 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC6Q99741 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC6Q99741 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC6Q99741 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC6Q99741 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC6Q99741 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC6Q99741 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC6Q99741 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC6Q99741 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC6Q99741 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC6Q99741 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC6Q99741 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC6Q99741 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC6Q99741 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC6Q99741 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC6Q99741 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC6Q99741 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC6Q99741 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC6Q99741 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC6Q99741 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC6Q99741 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC6Q99741 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC6Q99741 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC6Q99741 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC6Q99741 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC6Q99741 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDC6Q99741 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CDC6Q99741 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDC6Q99741 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDC6Q99741 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDC6Q99741 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDC6Q99741 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CDC6Q99741 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CDC6Q99741 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDC6Q99741 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC6Q99741 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC6Q99741 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC6Q99741 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC6Q99741 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC6Q99741 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC6Q99741 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC6Q99741 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC6Q99741 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC6Q99741 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC6Q99741 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC6Q99741 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC6Q99741 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC6Q99741 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC6Q99741 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC6Q99741 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC6Q99741 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC6Q99741 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC6Q99741 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC6Q99741 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC6Q99741 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC6Q99741 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC6Q99741 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC6Q99741 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC6Q99741 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDC6Q99741 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDC6Q99741 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDC6Q99741 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDC6Q99741 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDC6Q99741 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDC6Q99741 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDC6Q99741 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CDC6Q99741 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC6Q99741 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC6Q99741 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC6Q99741 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC6Q99741 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC6Q99741 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC6Q99741 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC6Q99741 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDC6Q99741 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDC6Q99741 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms