Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COPS8Q99627 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COPS8Q99627 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COPS8Q99627 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COPS8Q99627 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
COPS8Q99627 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COPS8Q99627 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COPS8Q99627 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
COPS8Q99627 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COPS8Q99627 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
COPS8Q99627 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COPS8Q99627 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COPS8Q99627 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COPS8Q99627 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COPS8Q99627 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COPS8Q99627 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COPS8Q99627 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COPS8Q99627 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COPS8Q99627 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COPS8Q99627 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COPS8Q99627 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COPS8Q99627 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COPS8Q99627 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COPS8Q99627 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COPS8Q99627 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COPS8Q99627 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COPS8Q99627 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPS8Q99627 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
COPS8Q99627 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPS8Q99627 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COPS8Q99627 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPS8Q99627 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPS8Q99627 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPS8Q99627 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPS8Q99627 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COPS8Q99627 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COPS8Q99627 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COPS8Q99627 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COPS8Q99627 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COPS8Q99627 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COPS8Q99627 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COPS8Q99627 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COPS8Q99627 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COPS8Q99627 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPS8Q99627 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPS8Q99627 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPS8Q99627 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPS8Q99627 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPS8Q99627 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPS8Q99627 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPS8Q99627 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPS8Q99627 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COPS8Q99627 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPS8Q99627 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPS8Q99627 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPS8Q99627 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
COPS8Q99627 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPS8Q99627 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COPS8Q99627 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPS8Q99627 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPS8Q99627 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPS8Q99627 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPS8Q99627 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPS8Q99627 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPS8Q99627 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPS8Q99627 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COPS8Q99627 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPS8Q99627 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPS8Q99627 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
COPS8Q99627 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPS8Q99627 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
COPS8Q99627 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPS8Q99627 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPS8Q99627 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
COPS8Q99627 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COPS8Q99627 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COPS8Q99627 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPS8Q99627 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPS8Q99627 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPS8Q99627 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPS8Q99627 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPS8Q99627 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COPS8Q99627 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COPS8Q99627 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COPS8Q99627 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COPS8Q99627 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COPS8Q99627 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPS8Q99627 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPS8Q99627 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPS8Q99627 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPS8Q99627 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
COPS8Q99627 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPS8Q99627 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPS8Q99627 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPS8Q99627 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPS8Q99627 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPS8Q99627 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPS8Q99627 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPS8Q99627 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPS8Q99627 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms