Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
NUP88Q99567 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NUP88Q99567 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NUP88Q99567 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUP88Q99567 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUP88Q99567 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUP88Q99567 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUP88Q99567 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NUP88Q99567 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NUP88Q99567 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NUP88Q99567 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NUP88Q99567 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NUP88Q99567 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUP88Q99567 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUP88Q99567 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUP88Q99567 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NUP88Q99567 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NUP88Q99567 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NUP88Q99567 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUP88Q99567 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUP88Q99567 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUP88Q99567 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUP88Q99567 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUP88Q99567 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUP88Q99567 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUP88Q99567 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
NUP88Q99567 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUP88Q99567 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NUP88Q99567 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NUP88Q99567 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
NUP88Q99567 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NUP88Q99567 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NUP88Q99567 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NUP88Q99567 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUP88Q99567 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUP88Q99567 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUP88Q99567 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUP88Q99567 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUP88Q99567 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
NUP88Q99567 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NUP88Q99567 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NUP88Q99567 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NUP88Q99567 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
NUP88Q99567 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NUP88Q99567 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NUP88Q99567 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NUP88Q99567 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NUP88Q99567 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NUP88Q99567 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NUP88Q99567 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NUP88Q99567 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NUP88Q99567 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NUP88Q99567 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NUP88Q99567 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NUP88Q99567 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NUP88Q99567 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NUP88Q99567 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NUP88Q99567 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NUP88Q99567 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NUP88Q99567 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
NUP88Q99567 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NUP88Q99567 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NUP88Q99567 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NUP88Q99567 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NUP88Q99567 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NUP88Q99567 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NUP88Q99567 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NUP88Q99567 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
NUP88Q99567 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NUP88Q99567 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NUP88Q99567 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NUP88Q99567 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NUP88Q99567 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NUP88Q99567 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NUP88Q99567 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NUP88Q99567 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NUP88Q99567 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NUP88Q99567 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NUP88Q99567 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NUP88Q99567 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NUP88Q99567 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NUP88Q99567 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUP88Q99567 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUP88Q99567 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUP88Q99567 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUP88Q99567 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUP88Q99567 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUP88Q99567 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUP88Q99567 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUP88Q99567 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NUP88Q99567 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NUP88Q99567 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NUP88Q99567 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NUP88Q99567 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NUP88Q99567 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NUP88Q99567 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NUP88Q99567 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NUP88Q99567 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NUP88Q99567 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NUP88Q99567 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms