Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PHOX2BQ99453 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PHOX2BQ99453 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PHOX2BQ99453 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHOX2BQ99453 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHOX2BQ99453 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHOX2BQ99453 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHOX2BQ99453 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHOX2BQ99453 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PHOX2BQ99453 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHOX2BQ99453 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHOX2BQ99453 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHOX2BQ99453 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHOX2BQ99453 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHOX2BQ99453 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHOX2BQ99453 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHOX2BQ99453 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PHOX2BQ99453 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHOX2BQ99453 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PHOX2BQ99453 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHOX2BQ99453 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHOX2BQ99453 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHOX2BQ99453 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PHOX2BQ99453 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHOX2BQ99453 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHOX2BQ99453 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHOX2BQ99453 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHOX2BQ99453 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHOX2BQ99453 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHOX2BQ99453 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHOX2BQ99453 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PHOX2BQ99453 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHOX2BQ99453 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHOX2BQ99453 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHOX2BQ99453 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHOX2BQ99453 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHOX2BQ99453 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHOX2BQ99453 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHOX2BQ99453 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHOX2BQ99453 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHOX2BQ99453 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHOX2BQ99453 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PHOX2BQ99453 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHOX2BQ99453 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHOX2BQ99453 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHOX2BQ99453 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHOX2BQ99453 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHOX2BQ99453 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PHOX2BQ99453 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHOX2BQ99453 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHOX2BQ99453 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHOX2BQ99453 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHOX2BQ99453 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHOX2BQ99453 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHOX2BQ99453 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHOX2BQ99453 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHOX2BQ99453 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHOX2BQ99453 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHOX2BQ99453 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHOX2BQ99453 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHOX2BQ99453 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHOX2BQ99453 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHOX2BQ99453 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PHOX2BQ99453 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PHOX2BQ99453 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PHOX2BQ99453 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PHOX2BQ99453 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PHOX2BQ99453 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PHOX2BQ99453 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PHOX2BQ99453 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PHOX2BQ99453 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PHOX2BQ99453 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHOX2BQ99453 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHOX2BQ99453 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHOX2BQ99453 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHOX2BQ99453 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHOX2BQ99453 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHOX2BQ99453 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHOX2BQ99453 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PHOX2BQ99453 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHOX2BQ99453 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHOX2BQ99453 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHOX2BQ99453 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHOX2BQ99453 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHOX2BQ99453 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHOX2BQ99453 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHOX2BQ99453 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHOX2BQ99453 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHOX2BQ99453 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHOX2BQ99453 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHOX2BQ99453 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHOX2BQ99453 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHOX2BQ99453 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHOX2BQ99453 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHOX2BQ99453 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHOX2BQ99453 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHOX2BQ99453 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHOX2BQ99453 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHOX2BQ99453 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHOX2BQ99453 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms