Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB4

SRPK1, SRSF protein kinase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK1Q96SB4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRPK1Q96SB4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRPK1Q96SB4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRPK1Q96SB4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRPK1Q96SB4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRPK1Q96SB4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SRPK1Q96SB4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRPK1Q96SB4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRPK1Q96SB4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRPK1Q96SB4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRPK1Q96SB4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRPK1Q96SB4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SRPK1Q96SB4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRPK1Q96SB4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SRPK1Q96SB4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SRPK1Q96SB4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SRPK1Q96SB4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SRPK1Q96SB4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRPK1Q96SB4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRPK1Q96SB4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRPK1Q96SB4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRPK1Q96SB4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRPK1Q96SB4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRPK1Q96SB4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRPK1Q96SB4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRPK1Q96SB4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRPK1Q96SB4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRPK1Q96SB4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SRPK1Q96SB4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRPK1Q96SB4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRPK1Q96SB4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRPK1Q96SB4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRPK1Q96SB4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRPK1Q96SB4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SRPK1Q96SB4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRPK1Q96SB4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRPK1Q96SB4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SRPK1Q96SB4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRPK1Q96SB4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRPK1Q96SB4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRPK1Q96SB4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRPK1Q96SB4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRPK1Q96SB4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRPK1Q96SB4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRPK1Q96SB4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRPK1Q96SB4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRPK1Q96SB4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRPK1Q96SB4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRPK1Q96SB4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRPK1Q96SB4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRPK1Q96SB4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRPK1Q96SB4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRPK1Q96SB4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRPK1Q96SB4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRPK1Q96SB4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRPK1Q96SB4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRPK1Q96SB4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRPK1Q96SB4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRPK1Q96SB4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRPK1Q96SB4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRPK1Q96SB4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRPK1Q96SB4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRPK1Q96SB4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRPK1Q96SB4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRPK1Q96SB4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRPK1Q96SB4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRPK1Q96SB4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRPK1Q96SB4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRPK1Q96SB4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRPK1Q96SB4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SRPK1Q96SB4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SRPK1Q96SB4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRPK1Q96SB4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRPK1Q96SB4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRPK1Q96SB4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRPK1Q96SB4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRPK1Q96SB4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRPK1Q96SB4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRPK1Q96SB4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SRPK1Q96SB4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRPK1Q96SB4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRPK1Q96SB4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRPK1Q96SB4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRPK1Q96SB4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SRPK1Q96SB4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRPK1Q96SB4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRPK1Q96SB4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRPK1Q96SB4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRPK1Q96SB4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRPK1Q96SB4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRPK1Q96SB4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRPK1Q96SB4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRPK1Q96SB4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRPK1Q96SB4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRPK1Q96SB4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRPK1Q96SB4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRPK1Q96SB4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRPK1Q96SB4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRPK1Q96SB4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SRPK1Q96SB4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms