Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF13CQ96RJ3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF13CQ96RJ3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF13CQ96RJ3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF13CQ96RJ3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF13CQ96RJ3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF13CQ96RJ3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TNFRSF13CQ96RJ3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF13CQ96RJ3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF13CQ96RJ3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF13CQ96RJ3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF13CQ96RJ3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF13CQ96RJ3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF13CQ96RJ3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF13CQ96RJ3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF13CQ96RJ3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF13CQ96RJ3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF13CQ96RJ3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF13CQ96RJ3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF13CQ96RJ3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF13CQ96RJ3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF13CQ96RJ3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF13CQ96RJ3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF13CQ96RJ3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF13CQ96RJ3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF13CQ96RJ3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF13CQ96RJ3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF13CQ96RJ3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF13CQ96RJ3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF13CQ96RJ3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFRSF13CQ96RJ3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF13CQ96RJ3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF13CQ96RJ3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF13CQ96RJ3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF13CQ96RJ3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF13CQ96RJ3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF13CQ96RJ3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF13CQ96RJ3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF13CQ96RJ3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF13CQ96RJ3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF13CQ96RJ3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF13CQ96RJ3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF13CQ96RJ3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFRSF13CQ96RJ3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF13CQ96RJ3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF13CQ96RJ3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF13CQ96RJ3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF13CQ96RJ3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF13CQ96RJ3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF13CQ96RJ3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF13CQ96RJ3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF13CQ96RJ3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF13CQ96RJ3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF13CQ96RJ3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF13CQ96RJ3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF13CQ96RJ3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF13CQ96RJ3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF13CQ96RJ3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF13CQ96RJ3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF13CQ96RJ3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF13CQ96RJ3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF13CQ96RJ3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF13CQ96RJ3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF13CQ96RJ3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF13CQ96RJ3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF13CQ96RJ3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF13CQ96RJ3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF13CQ96RJ3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF13CQ96RJ3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF13CQ96RJ3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF13CQ96RJ3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF13CQ96RJ3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF13CQ96RJ3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF13CQ96RJ3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF13CQ96RJ3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF13CQ96RJ3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF13CQ96RJ3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF13CQ96RJ3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF13CQ96RJ3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF13CQ96RJ3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF13CQ96RJ3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF13CQ96RJ3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF13CQ96RJ3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF13CQ96RJ3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF13CQ96RJ3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF13CQ96RJ3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF13CQ96RJ3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF13CQ96RJ3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF13CQ96RJ3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF13CQ96RJ3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF13CQ96RJ3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF13CQ96RJ3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF13CQ96RJ3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF13CQ96RJ3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF13CQ96RJ3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms