Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW7

LRRC7, Leucine-rich repeat-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC7Q96NW7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
LRRC7Q96NW7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
LRRC7Q96NW7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
LRRC7Q96NW7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC35.21■■■■□ 3.23
LRRC7Q96NW7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
LRRC7Q96NW7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
LRRC7Q96NW7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
LRRC7Q96NW7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
LRRC7Q96NW7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC35.2■■■■□ 3.23
LRRC7Q96NW7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
LRRC7Q96NW7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.22
LRRC7Q96NW7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
LRRC7Q96NW7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
LRRC7Q96NW7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
LRRC7Q96NW7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
LRRC7Q96NW7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
LRRC7Q96NW7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
LRRC7Q96NW7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
LRRC7Q96NW7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
LRRC7Q96NW7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
LRRC7Q96NW7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
LRRC7Q96NW7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
LRRC7Q96NW7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
LRRC7Q96NW7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
LRRC7Q96NW7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
LRRC7Q96NW7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
LRRC7Q96NW7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
LRRC7Q96NW7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
LRRC7Q96NW7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
LRRC7Q96NW7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
LRRC7Q96NW7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
LRRC7Q96NW7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
LRRC7Q96NW7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
LRRC7Q96NW7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
LRRC7Q96NW7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
LRRC7Q96NW7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
LRRC7Q96NW7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
LRRC7Q96NW7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
LRRC7Q96NW7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
LRRC7Q96NW7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
LRRC7Q96NW7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
LRRC7Q96NW7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
LRRC7Q96NW7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
LRRC7Q96NW7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
LRRC7Q96NW7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
LRRC7Q96NW7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
LRRC7Q96NW7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
LRRC7Q96NW7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
LRRC7Q96NW7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
LRRC7Q96NW7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
LRRC7Q96NW7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
LRRC7Q96NW7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
LRRC7Q96NW7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
LRRC7Q96NW7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC35.07■■■■□ 3.21
LRRC7Q96NW7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
LRRC7Q96NW7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
LRRC7Q96NW7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
LRRC7Q96NW7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
LRRC7Q96NW7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
LRRC7Q96NW7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
LRRC7Q96NW7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC35.05■■■■□ 3.2
LRRC7Q96NW7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
LRRC7Q96NW7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
LRRC7Q96NW7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
LRRC7Q96NW7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
LRRC7Q96NW7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
LRRC7Q96NW7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
LRRC7Q96NW7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
LRRC7Q96NW7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
LRRC7Q96NW7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
LRRC7Q96NW7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC35.01■■■■□ 3.2
LRRC7Q96NW7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.19
LRRC7Q96NW7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
LRRC7Q96NW7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC35■■■■□ 3.19
LRRC7Q96NW7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC35■■■■□ 3.19
LRRC7Q96NW7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
LRRC7Q96NW7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
LRRC7Q96NW7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
LRRC7Q96NW7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
LRRC7Q96NW7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
LRRC7Q96NW7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
LRRC7Q96NW7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
LRRC7Q96NW7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
LRRC7Q96NW7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
LRRC7Q96NW7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
LRRC7Q96NW7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
LRRC7Q96NW7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
LRRC7Q96NW7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
LRRC7Q96NW7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
LRRC7Q96NW7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
LRRC7Q96NW7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC34.96■■■■□ 3.19
LRRC7Q96NW7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
LRRC7Q96NW7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
LRRC7Q96NW7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
LRRC7Q96NW7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
LRRC7Q96NW7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC34.94■■■■□ 3.18
LRRC7Q96NW7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
LRRC7Q96NW7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
LRRC7Q96NW7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
LRRC7Q96NW7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms