Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU7

AMDHD1, Probable imidazolonepropionase, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMDHD1Q96NU7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AMDHD1Q96NU7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AMDHD1Q96NU7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AMDHD1Q96NU7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AMDHD1Q96NU7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AMDHD1Q96NU7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AMDHD1Q96NU7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AMDHD1Q96NU7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AMDHD1Q96NU7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AMDHD1Q96NU7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
AMDHD1Q96NU7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AMDHD1Q96NU7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AMDHD1Q96NU7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AMDHD1Q96NU7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AMDHD1Q96NU7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AMDHD1Q96NU7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AMDHD1Q96NU7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AMDHD1Q96NU7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
AMDHD1Q96NU7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AMDHD1Q96NU7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AMDHD1Q96NU7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMDHD1Q96NU7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMDHD1Q96NU7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMDHD1Q96NU7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMDHD1Q96NU7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
AMDHD1Q96NU7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AMDHD1Q96NU7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMDHD1Q96NU7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMDHD1Q96NU7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMDHD1Q96NU7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
AMDHD1Q96NU7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AMDHD1Q96NU7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
AMDHD1Q96NU7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMDHD1Q96NU7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMDHD1Q96NU7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMDHD1Q96NU7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMDHD1Q96NU7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMDHD1Q96NU7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMDHD1Q96NU7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMDHD1Q96NU7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMDHD1Q96NU7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMDHD1Q96NU7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMDHD1Q96NU7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMDHD1Q96NU7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMDHD1Q96NU7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMDHD1Q96NU7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMDHD1Q96NU7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMDHD1Q96NU7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMDHD1Q96NU7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMDHD1Q96NU7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
AMDHD1Q96NU7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMDHD1Q96NU7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMDHD1Q96NU7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMDHD1Q96NU7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMDHD1Q96NU7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMDHD1Q96NU7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
AMDHD1Q96NU7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AMDHD1Q96NU7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AMDHD1Q96NU7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AMDHD1Q96NU7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
AMDHD1Q96NU7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AMDHD1Q96NU7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AMDHD1Q96NU7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AMDHD1Q96NU7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AMDHD1Q96NU7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AMDHD1Q96NU7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AMDHD1Q96NU7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AMDHD1Q96NU7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AMDHD1Q96NU7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AMDHD1Q96NU7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AMDHD1Q96NU7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AMDHD1Q96NU7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AMDHD1Q96NU7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AMDHD1Q96NU7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AMDHD1Q96NU7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AMDHD1Q96NU7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AMDHD1Q96NU7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AMDHD1Q96NU7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AMDHD1Q96NU7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
AMDHD1Q96NU7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AMDHD1Q96NU7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AMDHD1Q96NU7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AMDHD1Q96NU7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AMDHD1Q96NU7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AMDHD1Q96NU7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AMDHD1Q96NU7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AMDHD1Q96NU7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AMDHD1Q96NU7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AMDHD1Q96NU7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AMDHD1Q96NU7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AMDHD1Q96NU7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AMDHD1Q96NU7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AMDHD1Q96NU7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AMDHD1Q96NU7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AMDHD1Q96NU7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AMDHD1Q96NU7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AMDHD1Q96NU7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AMDHD1Q96NU7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AMDHD1Q96NU7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AMDHD1Q96NU7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms