Protein–RNA interactions for Protein: Q96NI6

LRFN5, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN5Q96NI6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRFN5Q96NI6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRFN5Q96NI6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRFN5Q96NI6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRFN5Q96NI6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRFN5Q96NI6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRFN5Q96NI6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRFN5Q96NI6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRFN5Q96NI6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRFN5Q96NI6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRFN5Q96NI6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRFN5Q96NI6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRFN5Q96NI6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRFN5Q96NI6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRFN5Q96NI6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRFN5Q96NI6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRFN5Q96NI6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRFN5Q96NI6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRFN5Q96NI6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRFN5Q96NI6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRFN5Q96NI6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LRFN5Q96NI6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRFN5Q96NI6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRFN5Q96NI6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRFN5Q96NI6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRFN5Q96NI6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRFN5Q96NI6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRFN5Q96NI6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRFN5Q96NI6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRFN5Q96NI6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRFN5Q96NI6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRFN5Q96NI6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRFN5Q96NI6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRFN5Q96NI6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRFN5Q96NI6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRFN5Q96NI6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRFN5Q96NI6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRFN5Q96NI6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRFN5Q96NI6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRFN5Q96NI6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRFN5Q96NI6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRFN5Q96NI6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRFN5Q96NI6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRFN5Q96NI6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRFN5Q96NI6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRFN5Q96NI6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRFN5Q96NI6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRFN5Q96NI6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LRFN5Q96NI6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRFN5Q96NI6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRFN5Q96NI6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LRFN5Q96NI6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRFN5Q96NI6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRFN5Q96NI6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRFN5Q96NI6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRFN5Q96NI6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRFN5Q96NI6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRFN5Q96NI6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRFN5Q96NI6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRFN5Q96NI6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRFN5Q96NI6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRFN5Q96NI6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRFN5Q96NI6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRFN5Q96NI6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRFN5Q96NI6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRFN5Q96NI6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRFN5Q96NI6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRFN5Q96NI6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRFN5Q96NI6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRFN5Q96NI6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LRFN5Q96NI6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRFN5Q96NI6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LRFN5Q96NI6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRFN5Q96NI6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRFN5Q96NI6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRFN5Q96NI6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRFN5Q96NI6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRFN5Q96NI6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRFN5Q96NI6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRFN5Q96NI6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRFN5Q96NI6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRFN5Q96NI6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LRFN5Q96NI6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRFN5Q96NI6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRFN5Q96NI6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRFN5Q96NI6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRFN5Q96NI6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRFN5Q96NI6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRFN5Q96NI6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRFN5Q96NI6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRFN5Q96NI6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LRFN5Q96NI6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRFN5Q96NI6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LRFN5Q96NI6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRFN5Q96NI6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRFN5Q96NI6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRFN5Q96NI6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRFN5Q96NI6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRFN5Q96NI6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRFN5Q96NI6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms