Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN2

NLRP4, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP4Q96MN2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NLRP4Q96MN2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NLRP4Q96MN2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NLRP4Q96MN2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NLRP4Q96MN2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NLRP4Q96MN2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NLRP4Q96MN2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NLRP4Q96MN2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NLRP4Q96MN2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NLRP4Q96MN2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NLRP4Q96MN2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NLRP4Q96MN2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NLRP4Q96MN2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NLRP4Q96MN2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NLRP4Q96MN2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NLRP4Q96MN2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NLRP4Q96MN2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NLRP4Q96MN2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NLRP4Q96MN2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NLRP4Q96MN2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NLRP4Q96MN2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NLRP4Q96MN2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NLRP4Q96MN2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NLRP4Q96MN2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NLRP4Q96MN2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NLRP4Q96MN2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NLRP4Q96MN2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NLRP4Q96MN2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NLRP4Q96MN2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NLRP4Q96MN2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NLRP4Q96MN2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NLRP4Q96MN2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NLRP4Q96MN2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NLRP4Q96MN2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NLRP4Q96MN2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NLRP4Q96MN2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NLRP4Q96MN2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NLRP4Q96MN2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NLRP4Q96MN2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NLRP4Q96MN2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NLRP4Q96MN2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NLRP4Q96MN2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NLRP4Q96MN2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NLRP4Q96MN2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NLRP4Q96MN2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NLRP4Q96MN2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NLRP4Q96MN2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NLRP4Q96MN2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NLRP4Q96MN2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NLRP4Q96MN2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NLRP4Q96MN2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NLRP4Q96MN2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NLRP4Q96MN2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NLRP4Q96MN2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NLRP4Q96MN2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NLRP4Q96MN2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NLRP4Q96MN2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NLRP4Q96MN2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NLRP4Q96MN2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NLRP4Q96MN2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NLRP4Q96MN2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NLRP4Q96MN2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NLRP4Q96MN2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
NLRP4Q96MN2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NLRP4Q96MN2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NLRP4Q96MN2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NLRP4Q96MN2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NLRP4Q96MN2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NLRP4Q96MN2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NLRP4Q96MN2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NLRP4Q96MN2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NLRP4Q96MN2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NLRP4Q96MN2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NLRP4Q96MN2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NLRP4Q96MN2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NLRP4Q96MN2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NLRP4Q96MN2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NLRP4Q96MN2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NLRP4Q96MN2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NLRP4Q96MN2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NLRP4Q96MN2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NLRP4Q96MN2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NLRP4Q96MN2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NLRP4Q96MN2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NLRP4Q96MN2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NLRP4Q96MN2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NLRP4Q96MN2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NLRP4Q96MN2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NLRP4Q96MN2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NLRP4Q96MN2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NLRP4Q96MN2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NLRP4Q96MN2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NLRP4Q96MN2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NLRP4Q96MN2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NLRP4Q96MN2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NLRP4Q96MN2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NLRP4Q96MN2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NLRP4Q96MN2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NLRP4Q96MN2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NLRP4Q96MN2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms