Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NSMCE2Q96MF7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NSMCE2Q96MF7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NSMCE2Q96MF7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NSMCE2Q96MF7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NSMCE2Q96MF7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NSMCE2Q96MF7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NSMCE2Q96MF7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NSMCE2Q96MF7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NSMCE2Q96MF7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NSMCE2Q96MF7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NSMCE2Q96MF7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
NSMCE2Q96MF7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NSMCE2Q96MF7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NSMCE2Q96MF7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NSMCE2Q96MF7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NSMCE2Q96MF7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NSMCE2Q96MF7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NSMCE2Q96MF7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NSMCE2Q96MF7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NSMCE2Q96MF7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NSMCE2Q96MF7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NSMCE2Q96MF7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NSMCE2Q96MF7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSMCE2Q96MF7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSMCE2Q96MF7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NSMCE2Q96MF7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSMCE2Q96MF7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSMCE2Q96MF7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSMCE2Q96MF7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSMCE2Q96MF7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NSMCE2Q96MF7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NSMCE2Q96MF7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NSMCE2Q96MF7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NSMCE2Q96MF7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NSMCE2Q96MF7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NSMCE2Q96MF7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NSMCE2Q96MF7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSMCE2Q96MF7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSMCE2Q96MF7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSMCE2Q96MF7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSMCE2Q96MF7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSMCE2Q96MF7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSMCE2Q96MF7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSMCE2Q96MF7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NSMCE2Q96MF7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NSMCE2Q96MF7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NSMCE2Q96MF7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSMCE2Q96MF7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSMCE2Q96MF7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSMCE2Q96MF7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NSMCE2Q96MF7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSMCE2Q96MF7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSMCE2Q96MF7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSMCE2Q96MF7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSMCE2Q96MF7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSMCE2Q96MF7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSMCE2Q96MF7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSMCE2Q96MF7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSMCE2Q96MF7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSMCE2Q96MF7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSMCE2Q96MF7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSMCE2Q96MF7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSMCE2Q96MF7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSMCE2Q96MF7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSMCE2Q96MF7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NSMCE2Q96MF7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NSMCE2Q96MF7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NSMCE2Q96MF7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NSMCE2Q96MF7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NSMCE2Q96MF7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NSMCE2Q96MF7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NSMCE2Q96MF7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NSMCE2Q96MF7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NSMCE2Q96MF7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSMCE2Q96MF7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSMCE2Q96MF7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NSMCE2Q96MF7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSMCE2Q96MF7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSMCE2Q96MF7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSMCE2Q96MF7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSMCE2Q96MF7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSMCE2Q96MF7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSMCE2Q96MF7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSMCE2Q96MF7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSMCE2Q96MF7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NSMCE2Q96MF7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSMCE2Q96MF7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSMCE2Q96MF7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSMCE2Q96MF7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSMCE2Q96MF7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NSMCE2Q96MF7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NSMCE2Q96MF7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSMCE2Q96MF7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSMCE2Q96MF7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSMCE2Q96MF7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSMCE2Q96MF7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSMCE2Q96MF7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NSMCE2Q96MF7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NSMCE2Q96MF7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms