Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
FAM227BQ96M60 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FAM227BQ96M60 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
FAM227BQ96M60 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
FAM227BQ96M60 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
FAM227BQ96M60 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FAM227BQ96M60 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
FAM227BQ96M60 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
FAM227BQ96M60 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
FAM227BQ96M60 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FAM227BQ96M60 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FAM227BQ96M60 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FAM227BQ96M60 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FAM227BQ96M60 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FAM227BQ96M60 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FAM227BQ96M60 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FAM227BQ96M60 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FAM227BQ96M60 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FAM227BQ96M60 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FAM227BQ96M60 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FAM227BQ96M60 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FAM227BQ96M60 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FAM227BQ96M60 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FAM227BQ96M60 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FAM227BQ96M60 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FAM227BQ96M60 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FAM227BQ96M60 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FAM227BQ96M60 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FAM227BQ96M60 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FAM227BQ96M60 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FAM227BQ96M60 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FAM227BQ96M60 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
FAM227BQ96M60 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
FAM227BQ96M60 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FAM227BQ96M60 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
FAM227BQ96M60 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FAM227BQ96M60 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
FAM227BQ96M60 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
FAM227BQ96M60 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
FAM227BQ96M60 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FAM227BQ96M60 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
FAM227BQ96M60 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FAM227BQ96M60 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FAM227BQ96M60 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FAM227BQ96M60 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FAM227BQ96M60 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FAM227BQ96M60 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FAM227BQ96M60 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FAM227BQ96M60 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FAM227BQ96M60 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FAM227BQ96M60 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FAM227BQ96M60 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FAM227BQ96M60 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FAM227BQ96M60 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FAM227BQ96M60 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FAM227BQ96M60 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
FAM227BQ96M60 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
FAM227BQ96M60 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
FAM227BQ96M60 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FAM227BQ96M60 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FAM227BQ96M60 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FAM227BQ96M60 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FAM227BQ96M60 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
FAM227BQ96M60 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
FAM227BQ96M60 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FAM227BQ96M60 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FAM227BQ96M60 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FAM227BQ96M60 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FAM227BQ96M60 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FAM227BQ96M60 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
FAM227BQ96M60 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
FAM227BQ96M60 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FAM227BQ96M60 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FAM227BQ96M60 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FAM227BQ96M60 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FAM227BQ96M60 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FAM227BQ96M60 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FAM227BQ96M60 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
FAM227BQ96M60 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FAM227BQ96M60 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
FAM227BQ96M60 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FAM227BQ96M60 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
FAM227BQ96M60 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FAM227BQ96M60 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FAM227BQ96M60 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FAM227BQ96M60 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FAM227BQ96M60 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FAM227BQ96M60 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
FAM227BQ96M60 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FAM227BQ96M60 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
FAM227BQ96M60 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FAM227BQ96M60 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
FAM227BQ96M60 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
FAM227BQ96M60 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FAM227BQ96M60 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
FAM227BQ96M60 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
FAM227BQ96M60 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FAM227BQ96M60 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
FAM227BQ96M60 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
FAM227BQ96M60 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms