Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNX27Q96L92 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNX27Q96L92 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SNX27Q96L92 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNX27Q96L92 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SNX27Q96L92 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNX27Q96L92 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNX27Q96L92 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SNX27Q96L92 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNX27Q96L92 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SNX27Q96L92 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SNX27Q96L92 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNX27Q96L92 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNX27Q96L92 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX27Q96L92 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX27Q96L92 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX27Q96L92 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX27Q96L92 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX27Q96L92 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX27Q96L92 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX27Q96L92 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX27Q96L92 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX27Q96L92 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX27Q96L92 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX27Q96L92 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SNX27Q96L92 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SNX27Q96L92 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNX27Q96L92 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNX27Q96L92 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNX27Q96L92 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX27Q96L92 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX27Q96L92 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX27Q96L92 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX27Q96L92 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX27Q96L92 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX27Q96L92 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX27Q96L92 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNX27Q96L92 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNX27Q96L92 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNX27Q96L92 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNX27Q96L92 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX27Q96L92 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX27Q96L92 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX27Q96L92 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX27Q96L92 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNX27Q96L92 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNX27Q96L92 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNX27Q96L92 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNX27Q96L92 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SNX27Q96L92 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX27Q96L92 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNX27Q96L92 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNX27Q96L92 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNX27Q96L92 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNX27Q96L92 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX27Q96L92 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX27Q96L92 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX27Q96L92 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX27Q96L92 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX27Q96L92 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX27Q96L92 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX27Q96L92 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SNX27Q96L92 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SNX27Q96L92 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNX27Q96L92 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX27Q96L92 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX27Q96L92 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX27Q96L92 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX27Q96L92 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX27Q96L92 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNX27Q96L92 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNX27Q96L92 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNX27Q96L92 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SNX27Q96L92 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNX27Q96L92 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SNX27Q96L92 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNX27Q96L92 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNX27Q96L92 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SNX27Q96L92 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNX27Q96L92 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNX27Q96L92 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNX27Q96L92 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNX27Q96L92 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNX27Q96L92 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNX27Q96L92 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNX27Q96L92 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNX27Q96L92 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNX27Q96L92 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNX27Q96L92 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNX27Q96L92 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNX27Q96L92 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNX27Q96L92 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNX27Q96L92 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNX27Q96L92 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX27Q96L92 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX27Q96L92 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX27Q96L92 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX27Q96L92 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX27Q96L92 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX27Q96L92 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms