Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAX2Q96IS3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAX2Q96IS3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RAX2Q96IS3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAX2Q96IS3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RAX2Q96IS3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAX2Q96IS3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAX2Q96IS3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RAX2Q96IS3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAX2Q96IS3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAX2Q96IS3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAX2Q96IS3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RAX2Q96IS3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RAX2Q96IS3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RAX2Q96IS3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RAX2Q96IS3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RAX2Q96IS3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RAX2Q96IS3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAX2Q96IS3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAX2Q96IS3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAX2Q96IS3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAX2Q96IS3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAX2Q96IS3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAX2Q96IS3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAX2Q96IS3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAX2Q96IS3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAX2Q96IS3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RAX2Q96IS3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAX2Q96IS3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RAX2Q96IS3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAX2Q96IS3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAX2Q96IS3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAX2Q96IS3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAX2Q96IS3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAX2Q96IS3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAX2Q96IS3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAX2Q96IS3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAX2Q96IS3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAX2Q96IS3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAX2Q96IS3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAX2Q96IS3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAX2Q96IS3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAX2Q96IS3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAX2Q96IS3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAX2Q96IS3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RAX2Q96IS3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAX2Q96IS3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAX2Q96IS3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAX2Q96IS3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAX2Q96IS3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAX2Q96IS3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RAX2Q96IS3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAX2Q96IS3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAX2Q96IS3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAX2Q96IS3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAX2Q96IS3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAX2Q96IS3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAX2Q96IS3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAX2Q96IS3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAX2Q96IS3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAX2Q96IS3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAX2Q96IS3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RAX2Q96IS3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAX2Q96IS3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAX2Q96IS3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAX2Q96IS3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAX2Q96IS3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAX2Q96IS3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAX2Q96IS3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAX2Q96IS3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAX2Q96IS3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAX2Q96IS3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAX2Q96IS3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAX2Q96IS3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RAX2Q96IS3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAX2Q96IS3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAX2Q96IS3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAX2Q96IS3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAX2Q96IS3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RAX2Q96IS3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAX2Q96IS3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAX2Q96IS3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAX2Q96IS3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAX2Q96IS3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAX2Q96IS3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAX2Q96IS3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAX2Q96IS3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAX2Q96IS3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAX2Q96IS3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAX2Q96IS3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAX2Q96IS3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAX2Q96IS3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAX2Q96IS3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAX2Q96IS3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAX2Q96IS3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAX2Q96IS3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAX2Q96IS3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAX2Q96IS3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAX2Q96IS3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAX2Q96IS3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms