Protein–RNA interactions for Protein: Q96E40

SPACA9, Sperm acrosome-associated protein 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPACA9Q96E40 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPACA9Q96E40 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SPACA9Q96E40 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPACA9Q96E40 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPACA9Q96E40 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPACA9Q96E40 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPACA9Q96E40 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPACA9Q96E40 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPACA9Q96E40 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPACA9Q96E40 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SPACA9Q96E40 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPACA9Q96E40 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPACA9Q96E40 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPACA9Q96E40 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPACA9Q96E40 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPACA9Q96E40 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPACA9Q96E40 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPACA9Q96E40 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPACA9Q96E40 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SPACA9Q96E40 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPACA9Q96E40 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPACA9Q96E40 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPACA9Q96E40 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPACA9Q96E40 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SPACA9Q96E40 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPACA9Q96E40 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPACA9Q96E40 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPACA9Q96E40 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPACA9Q96E40 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPACA9Q96E40 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPACA9Q96E40 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPACA9Q96E40 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPACA9Q96E40 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPACA9Q96E40 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SPACA9Q96E40 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPACA9Q96E40 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPACA9Q96E40 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPACA9Q96E40 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPACA9Q96E40 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SPACA9Q96E40 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SPACA9Q96E40 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPACA9Q96E40 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPACA9Q96E40 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPACA9Q96E40 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SPACA9Q96E40 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPACA9Q96E40 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPACA9Q96E40 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPACA9Q96E40 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SPACA9Q96E40 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPACA9Q96E40 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPACA9Q96E40 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPACA9Q96E40 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPACA9Q96E40 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPACA9Q96E40 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPACA9Q96E40 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPACA9Q96E40 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPACA9Q96E40 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPACA9Q96E40 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPACA9Q96E40 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SPACA9Q96E40 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPACA9Q96E40 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPACA9Q96E40 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPACA9Q96E40 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPACA9Q96E40 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPACA9Q96E40 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SPACA9Q96E40 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPACA9Q96E40 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPACA9Q96E40 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPACA9Q96E40 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPACA9Q96E40 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPACA9Q96E40 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPACA9Q96E40 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPACA9Q96E40 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPACA9Q96E40 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPACA9Q96E40 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPACA9Q96E40 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPACA9Q96E40 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPACA9Q96E40 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SPACA9Q96E40 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SPACA9Q96E40 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPACA9Q96E40 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPACA9Q96E40 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPACA9Q96E40 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPACA9Q96E40 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPACA9Q96E40 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SPACA9Q96E40 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPACA9Q96E40 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPACA9Q96E40 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPACA9Q96E40 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPACA9Q96E40 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPACA9Q96E40 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPACA9Q96E40 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPACA9Q96E40 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPACA9Q96E40 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPACA9Q96E40 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPACA9Q96E40 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPACA9Q96E40 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPACA9Q96E40 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPACA9Q96E40 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SPACA9Q96E40 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms