Protein–RNA interactions for Protein: Q96E11

MRRF, Ribosome-recycling factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRRFQ96E11 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MRRFQ96E11 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MRRFQ96E11 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MRRFQ96E11 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MRRFQ96E11 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MRRFQ96E11 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MRRFQ96E11 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MRRFQ96E11 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MRRFQ96E11 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MRRFQ96E11 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MRRFQ96E11 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MRRFQ96E11 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MRRFQ96E11 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MRRFQ96E11 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MRRFQ96E11 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MRRFQ96E11 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MRRFQ96E11 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MRRFQ96E11 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MRRFQ96E11 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MRRFQ96E11 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MRRFQ96E11 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MRRFQ96E11 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MRRFQ96E11 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MRRFQ96E11 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MRRFQ96E11 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MRRFQ96E11 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MRRFQ96E11 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MRRFQ96E11 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MRRFQ96E11 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MRRFQ96E11 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MRRFQ96E11 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MRRFQ96E11 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MRRFQ96E11 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MRRFQ96E11 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MRRFQ96E11 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MRRFQ96E11 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MRRFQ96E11 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MRRFQ96E11 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MRRFQ96E11 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MRRFQ96E11 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MRRFQ96E11 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MRRFQ96E11 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MRRFQ96E11 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MRRFQ96E11 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MRRFQ96E11 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MRRFQ96E11 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MRRFQ96E11 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MRRFQ96E11 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MRRFQ96E11 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MRRFQ96E11 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MRRFQ96E11 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRRFQ96E11 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRRFQ96E11 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRRFQ96E11 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRRFQ96E11 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRRFQ96E11 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRRFQ96E11 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRRFQ96E11 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRRFQ96E11 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MRRFQ96E11 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MRRFQ96E11 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MRRFQ96E11 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MRRFQ96E11 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MRRFQ96E11 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MRRFQ96E11 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MRRFQ96E11 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRRFQ96E11 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRRFQ96E11 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRRFQ96E11 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRRFQ96E11 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRRFQ96E11 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRRFQ96E11 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRRFQ96E11 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRRFQ96E11 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MRRFQ96E11 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MRRFQ96E11 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRRFQ96E11 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRRFQ96E11 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRRFQ96E11 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRRFQ96E11 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRRFQ96E11 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRRFQ96E11 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRRFQ96E11 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRRFQ96E11 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRRFQ96E11 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRRFQ96E11 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRRFQ96E11 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRRFQ96E11 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRRFQ96E11 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRRFQ96E11 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MRRFQ96E11 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MRRFQ96E11 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MRRFQ96E11 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRRFQ96E11 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MRRFQ96E11 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRRFQ96E11 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRRFQ96E11 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRRFQ96E11 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRRFQ96E11 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRRFQ96E11 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms