Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ7

TM4SF19, Transmembrane 4 L6 family member 19, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF19Q96DZ7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM4SF19Q96DZ7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM4SF19Q96DZ7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM4SF19Q96DZ7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TM4SF19Q96DZ7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM4SF19Q96DZ7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM4SF19Q96DZ7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM4SF19Q96DZ7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM4SF19Q96DZ7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TM4SF19Q96DZ7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TM4SF19Q96DZ7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TM4SF19Q96DZ7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TM4SF19Q96DZ7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TM4SF19Q96DZ7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TM4SF19Q96DZ7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM4SF19Q96DZ7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM4SF19Q96DZ7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM4SF19Q96DZ7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM4SF19Q96DZ7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TM4SF19Q96DZ7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TM4SF19Q96DZ7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TM4SF19Q96DZ7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TM4SF19Q96DZ7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TM4SF19Q96DZ7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TM4SF19Q96DZ7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TM4SF19Q96DZ7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TM4SF19Q96DZ7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TM4SF19Q96DZ7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TM4SF19Q96DZ7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM4SF19Q96DZ7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM4SF19Q96DZ7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM4SF19Q96DZ7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM4SF19Q96DZ7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM4SF19Q96DZ7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM4SF19Q96DZ7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM4SF19Q96DZ7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM4SF19Q96DZ7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM4SF19Q96DZ7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM4SF19Q96DZ7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TM4SF19Q96DZ7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM4SF19Q96DZ7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM4SF19Q96DZ7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM4SF19Q96DZ7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM4SF19Q96DZ7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TM4SF19Q96DZ7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM4SF19Q96DZ7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TM4SF19Q96DZ7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TM4SF19Q96DZ7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF19Q96DZ7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF19Q96DZ7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF19Q96DZ7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF19Q96DZ7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF19Q96DZ7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TM4SF19Q96DZ7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TM4SF19Q96DZ7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TM4SF19Q96DZ7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TM4SF19Q96DZ7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TM4SF19Q96DZ7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TM4SF19Q96DZ7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TM4SF19Q96DZ7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TM4SF19Q96DZ7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM4SF19Q96DZ7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM4SF19Q96DZ7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM4SF19Q96DZ7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM4SF19Q96DZ7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM4SF19Q96DZ7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM4SF19Q96DZ7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TM4SF19Q96DZ7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM4SF19Q96DZ7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM4SF19Q96DZ7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TM4SF19Q96DZ7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM4SF19Q96DZ7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM4SF19Q96DZ7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM4SF19Q96DZ7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM4SF19Q96DZ7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM4SF19Q96DZ7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM4SF19Q96DZ7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM4SF19Q96DZ7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM4SF19Q96DZ7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM4SF19Q96DZ7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM4SF19Q96DZ7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM4SF19Q96DZ7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM4SF19Q96DZ7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM4SF19Q96DZ7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM4SF19Q96DZ7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM4SF19Q96DZ7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TM4SF19Q96DZ7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TM4SF19Q96DZ7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TM4SF19Q96DZ7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TM4SF19Q96DZ7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TM4SF19Q96DZ7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TM4SF19Q96DZ7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TM4SF19Q96DZ7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM4SF19Q96DZ7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM4SF19Q96DZ7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TM4SF19Q96DZ7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM4SF19Q96DZ7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF19Q96DZ7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF19Q96DZ7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM4SF19Q96DZ7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms