Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM44Q96DX7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM44Q96DX7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM44Q96DX7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM44Q96DX7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM44Q96DX7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM44Q96DX7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM44Q96DX7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM44Q96DX7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM44Q96DX7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM44Q96DX7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM44Q96DX7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM44Q96DX7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM44Q96DX7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM44Q96DX7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM44Q96DX7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM44Q96DX7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM44Q96DX7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM44Q96DX7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM44Q96DX7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM44Q96DX7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM44Q96DX7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM44Q96DX7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM44Q96DX7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM44Q96DX7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM44Q96DX7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM44Q96DX7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM44Q96DX7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM44Q96DX7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM44Q96DX7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM44Q96DX7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM44Q96DX7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRIM44Q96DX7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRIM44Q96DX7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM44Q96DX7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM44Q96DX7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM44Q96DX7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM44Q96DX7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM44Q96DX7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM44Q96DX7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM44Q96DX7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM44Q96DX7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM44Q96DX7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM44Q96DX7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM44Q96DX7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM44Q96DX7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM44Q96DX7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM44Q96DX7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM44Q96DX7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM44Q96DX7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM44Q96DX7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM44Q96DX7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM44Q96DX7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM44Q96DX7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM44Q96DX7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM44Q96DX7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM44Q96DX7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM44Q96DX7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM44Q96DX7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM44Q96DX7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM44Q96DX7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM44Q96DX7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM44Q96DX7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM44Q96DX7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM44Q96DX7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM44Q96DX7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM44Q96DX7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM44Q96DX7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM44Q96DX7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM44Q96DX7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM44Q96DX7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM44Q96DX7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM44Q96DX7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM44Q96DX7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM44Q96DX7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM44Q96DX7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM44Q96DX7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM44Q96DX7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TRIM44Q96DX7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM44Q96DX7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM44Q96DX7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM44Q96DX7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM44Q96DX7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM44Q96DX7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM44Q96DX7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM44Q96DX7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM44Q96DX7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM44Q96DX7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM44Q96DX7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM44Q96DX7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM44Q96DX7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM44Q96DX7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM44Q96DX7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM44Q96DX7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM44Q96DX7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM44Q96DX7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM44Q96DX7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM44Q96DX7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM44Q96DX7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM44Q96DX7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms