Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD7

SHISA4, Protein shisa-4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA4Q96DD7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SHISA4Q96DD7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SHISA4Q96DD7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SHISA4Q96DD7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SHISA4Q96DD7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SHISA4Q96DD7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SHISA4Q96DD7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SHISA4Q96DD7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SHISA4Q96DD7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SHISA4Q96DD7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SHISA4Q96DD7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SHISA4Q96DD7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SHISA4Q96DD7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SHISA4Q96DD7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SHISA4Q96DD7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHISA4Q96DD7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHISA4Q96DD7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHISA4Q96DD7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHISA4Q96DD7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHISA4Q96DD7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHISA4Q96DD7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHISA4Q96DD7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHISA4Q96DD7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHISA4Q96DD7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SHISA4Q96DD7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SHISA4Q96DD7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SHISA4Q96DD7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SHISA4Q96DD7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SHISA4Q96DD7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SHISA4Q96DD7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SHISA4Q96DD7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SHISA4Q96DD7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SHISA4Q96DD7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SHISA4Q96DD7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SHISA4Q96DD7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SHISA4Q96DD7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SHISA4Q96DD7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SHISA4Q96DD7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SHISA4Q96DD7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SHISA4Q96DD7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SHISA4Q96DD7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SHISA4Q96DD7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SHISA4Q96DD7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SHISA4Q96DD7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SHISA4Q96DD7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SHISA4Q96DD7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SHISA4Q96DD7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SHISA4Q96DD7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SHISA4Q96DD7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SHISA4Q96DD7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SHISA4Q96DD7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SHISA4Q96DD7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SHISA4Q96DD7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SHISA4Q96DD7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SHISA4Q96DD7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SHISA4Q96DD7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SHISA4Q96DD7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SHISA4Q96DD7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SHISA4Q96DD7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SHISA4Q96DD7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SHISA4Q96DD7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SHISA4Q96DD7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SHISA4Q96DD7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SHISA4Q96DD7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SHISA4Q96DD7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SHISA4Q96DD7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SHISA4Q96DD7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SHISA4Q96DD7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SHISA4Q96DD7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SHISA4Q96DD7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SHISA4Q96DD7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SHISA4Q96DD7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SHISA4Q96DD7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SHISA4Q96DD7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SHISA4Q96DD7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SHISA4Q96DD7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SHISA4Q96DD7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SHISA4Q96DD7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SHISA4Q96DD7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SHISA4Q96DD7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SHISA4Q96DD7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SHISA4Q96DD7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SHISA4Q96DD7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SHISA4Q96DD7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SHISA4Q96DD7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SHISA4Q96DD7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SHISA4Q96DD7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SHISA4Q96DD7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SHISA4Q96DD7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SHISA4Q96DD7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SHISA4Q96DD7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SHISA4Q96DD7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SHISA4Q96DD7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SHISA4Q96DD7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SHISA4Q96DD7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SHISA4Q96DD7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SHISA4Q96DD7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SHISA4Q96DD7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SHISA4Q96DD7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SHISA4Q96DD7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.2 ms