Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC11Q96DB2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC11Q96DB2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC11Q96DB2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC11Q96DB2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC11Q96DB2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC11Q96DB2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC11Q96DB2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC11Q96DB2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC11Q96DB2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC11Q96DB2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC11Q96DB2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC11Q96DB2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
HDAC11Q96DB2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
HDAC11Q96DB2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HDAC11Q96DB2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDAC11Q96DB2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDAC11Q96DB2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDAC11Q96DB2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDAC11Q96DB2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HDAC11Q96DB2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC11Q96DB2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC11Q96DB2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC11Q96DB2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC11Q96DB2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC11Q96DB2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDAC11Q96DB2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC11Q96DB2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC11Q96DB2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC11Q96DB2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDAC11Q96DB2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC11Q96DB2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC11Q96DB2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC11Q96DB2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC11Q96DB2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDAC11Q96DB2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC11Q96DB2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDAC11Q96DB2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDAC11Q96DB2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDAC11Q96DB2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDAC11Q96DB2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HDAC11Q96DB2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC11Q96DB2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC11Q96DB2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC11Q96DB2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC11Q96DB2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC11Q96DB2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC11Q96DB2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDAC11Q96DB2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC11Q96DB2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC11Q96DB2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC11Q96DB2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC11Q96DB2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC11Q96DB2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC11Q96DB2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC11Q96DB2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC11Q96DB2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC11Q96DB2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC11Q96DB2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC11Q96DB2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDAC11Q96DB2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC11Q96DB2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC11Q96DB2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC11Q96DB2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC11Q96DB2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDAC11Q96DB2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC11Q96DB2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC11Q96DB2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC11Q96DB2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC11Q96DB2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC11Q96DB2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC11Q96DB2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC11Q96DB2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDAC11Q96DB2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC11Q96DB2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC11Q96DB2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC11Q96DB2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC11Q96DB2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC11Q96DB2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC11Q96DB2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC11Q96DB2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HDAC11Q96DB2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HDAC11Q96DB2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC11Q96DB2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC11Q96DB2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC11Q96DB2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC11Q96DB2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC11Q96DB2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC11Q96DB2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC11Q96DB2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC11Q96DB2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC11Q96DB2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC11Q96DB2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC11Q96DB2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC11Q96DB2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC11Q96DB2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC11Q96DB2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC11Q96DB2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC11Q96DB2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC11Q96DB2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms