Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT2

KLHL29, Kelch-like protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL29Q96CT2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL29Q96CT2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL29Q96CT2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL29Q96CT2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL29Q96CT2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL29Q96CT2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL29Q96CT2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL29Q96CT2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL29Q96CT2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL29Q96CT2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL29Q96CT2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL29Q96CT2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL29Q96CT2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL29Q96CT2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL29Q96CT2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL29Q96CT2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL29Q96CT2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL29Q96CT2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL29Q96CT2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL29Q96CT2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL29Q96CT2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL29Q96CT2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL29Q96CT2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL29Q96CT2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL29Q96CT2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL29Q96CT2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL29Q96CT2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL29Q96CT2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL29Q96CT2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL29Q96CT2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL29Q96CT2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL29Q96CT2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL29Q96CT2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL29Q96CT2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL29Q96CT2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL29Q96CT2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL29Q96CT2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL29Q96CT2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL29Q96CT2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL29Q96CT2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL29Q96CT2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL29Q96CT2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL29Q96CT2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL29Q96CT2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL29Q96CT2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL29Q96CT2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL29Q96CT2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL29Q96CT2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL29Q96CT2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL29Q96CT2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL29Q96CT2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL29Q96CT2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL29Q96CT2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL29Q96CT2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL29Q96CT2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL29Q96CT2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL29Q96CT2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL29Q96CT2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KLHL29Q96CT2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
KLHL29Q96CT2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL29Q96CT2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL29Q96CT2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL29Q96CT2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL29Q96CT2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL29Q96CT2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL29Q96CT2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL29Q96CT2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KLHL29Q96CT2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL29Q96CT2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL29Q96CT2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL29Q96CT2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL29Q96CT2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL29Q96CT2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KLHL29Q96CT2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL29Q96CT2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL29Q96CT2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL29Q96CT2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL29Q96CT2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL29Q96CT2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL29Q96CT2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL29Q96CT2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL29Q96CT2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL29Q96CT2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL29Q96CT2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL29Q96CT2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL29Q96CT2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KLHL29Q96CT2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL29Q96CT2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL29Q96CT2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL29Q96CT2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KLHL29Q96CT2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL29Q96CT2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL29Q96CT2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL29Q96CT2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL29Q96CT2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL29Q96CT2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL29Q96CT2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL29Q96CT2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL29Q96CT2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KLHL29Q96CT2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1005.7 ms