Protein–RNA interactions for Protein: Q96CC6

RHBDF1, Inactive rhomboid protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF1Q96CC6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHBDF1Q96CC6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHBDF1Q96CC6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHBDF1Q96CC6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHBDF1Q96CC6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHBDF1Q96CC6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHBDF1Q96CC6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHBDF1Q96CC6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHBDF1Q96CC6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHBDF1Q96CC6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHBDF1Q96CC6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHBDF1Q96CC6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHBDF1Q96CC6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHBDF1Q96CC6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHBDF1Q96CC6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHBDF1Q96CC6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHBDF1Q96CC6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHBDF1Q96CC6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHBDF1Q96CC6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHBDF1Q96CC6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHBDF1Q96CC6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHBDF1Q96CC6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHBDF1Q96CC6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHBDF1Q96CC6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHBDF1Q96CC6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RHBDF1Q96CC6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RHBDF1Q96CC6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RHBDF1Q96CC6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RHBDF1Q96CC6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RHBDF1Q96CC6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RHBDF1Q96CC6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHBDF1Q96CC6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHBDF1Q96CC6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHBDF1Q96CC6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHBDF1Q96CC6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHBDF1Q96CC6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHBDF1Q96CC6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHBDF1Q96CC6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHBDF1Q96CC6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHBDF1Q96CC6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHBDF1Q96CC6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHBDF1Q96CC6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHBDF1Q96CC6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHBDF1Q96CC6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHBDF1Q96CC6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHBDF1Q96CC6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHBDF1Q96CC6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHBDF1Q96CC6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHBDF1Q96CC6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHBDF1Q96CC6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RHBDF1Q96CC6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHBDF1Q96CC6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RHBDF1Q96CC6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHBDF1Q96CC6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHBDF1Q96CC6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHBDF1Q96CC6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RHBDF1Q96CC6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHBDF1Q96CC6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHBDF1Q96CC6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHBDF1Q96CC6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RHBDF1Q96CC6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHBDF1Q96CC6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHBDF1Q96CC6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHBDF1Q96CC6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHBDF1Q96CC6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHBDF1Q96CC6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHBDF1Q96CC6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHBDF1Q96CC6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHBDF1Q96CC6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
RHBDF1Q96CC6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHBDF1Q96CC6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHBDF1Q96CC6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHBDF1Q96CC6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHBDF1Q96CC6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHBDF1Q96CC6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHBDF1Q96CC6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHBDF1Q96CC6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHBDF1Q96CC6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHBDF1Q96CC6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHBDF1Q96CC6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHBDF1Q96CC6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHBDF1Q96CC6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHBDF1Q96CC6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHBDF1Q96CC6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHBDF1Q96CC6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHBDF1Q96CC6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHBDF1Q96CC6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHBDF1Q96CC6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHBDF1Q96CC6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHBDF1Q96CC6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHBDF1Q96CC6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHBDF1Q96CC6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHBDF1Q96CC6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHBDF1Q96CC6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHBDF1Q96CC6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHBDF1Q96CC6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHBDF1Q96CC6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHBDF1Q96CC6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHBDF1Q96CC6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHBDF1Q96CC6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms