Protein–RNA interactions for Protein: Q96A29

SLC35C1, GDP-fucose transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35C1Q96A29 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC35C1Q96A29 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC35C1Q96A29 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC35C1Q96A29 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC35C1Q96A29 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC35C1Q96A29 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC35C1Q96A29 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC35C1Q96A29 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC35C1Q96A29 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC35C1Q96A29 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC35C1Q96A29 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC35C1Q96A29 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC35C1Q96A29 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC35C1Q96A29 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC35C1Q96A29 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC35C1Q96A29 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC35C1Q96A29 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC35C1Q96A29 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC35C1Q96A29 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC35C1Q96A29 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC35C1Q96A29 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC35C1Q96A29 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC35C1Q96A29 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC35C1Q96A29 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC35C1Q96A29 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC35C1Q96A29 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC35C1Q96A29 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC35C1Q96A29 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC35C1Q96A29 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC35C1Q96A29 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC35C1Q96A29 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC35C1Q96A29 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC35C1Q96A29 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC35C1Q96A29 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC35C1Q96A29 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC35C1Q96A29 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC35C1Q96A29 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC35C1Q96A29 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC35C1Q96A29 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLC35C1Q96A29 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLC35C1Q96A29 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLC35C1Q96A29 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC35C1Q96A29 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC35C1Q96A29 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC35C1Q96A29 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC35C1Q96A29 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC35C1Q96A29 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC35C1Q96A29 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC35C1Q96A29 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC35C1Q96A29 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC35C1Q96A29 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC35C1Q96A29 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC35C1Q96A29 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC35C1Q96A29 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC35C1Q96A29 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC35C1Q96A29 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC35C1Q96A29 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC35C1Q96A29 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC35C1Q96A29 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC35C1Q96A29 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC35C1Q96A29 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC35C1Q96A29 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC35C1Q96A29 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC35C1Q96A29 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC35C1Q96A29 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC35C1Q96A29 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC35C1Q96A29 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC35C1Q96A29 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC35C1Q96A29 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC35C1Q96A29 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC35C1Q96A29 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC35C1Q96A29 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC35C1Q96A29 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC35C1Q96A29 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC35C1Q96A29 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC35C1Q96A29 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC35C1Q96A29 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC35C1Q96A29 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC35C1Q96A29 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC35C1Q96A29 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC35C1Q96A29 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC35C1Q96A29 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC35C1Q96A29 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC35C1Q96A29 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC35C1Q96A29 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC35C1Q96A29 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC35C1Q96A29 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC35C1Q96A29 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC35C1Q96A29 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC35C1Q96A29 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC35C1Q96A29 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC35C1Q96A29 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC35C1Q96A29 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC35C1Q96A29 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC35C1Q96A29 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC35C1Q96A29 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC35C1Q96A29 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC35C1Q96A29 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC35C1Q96A29 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC35C1Q96A29 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms