Protein–RNA interactions for Protein: Q969K7

TMEM54, Transmembrane protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54Q969K7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM54Q969K7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM54Q969K7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM54Q969K7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM54Q969K7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM54Q969K7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM54Q969K7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM54Q969K7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM54Q969K7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM54Q969K7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM54Q969K7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM54Q969K7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM54Q969K7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM54Q969K7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM54Q969K7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM54Q969K7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM54Q969K7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM54Q969K7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM54Q969K7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM54Q969K7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TMEM54Q969K7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM54Q969K7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM54Q969K7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM54Q969K7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM54Q969K7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM54Q969K7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM54Q969K7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM54Q969K7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM54Q969K7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM54Q969K7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM54Q969K7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM54Q969K7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM54Q969K7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM54Q969K7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM54Q969K7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM54Q969K7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM54Q969K7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM54Q969K7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM54Q969K7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM54Q969K7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM54Q969K7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM54Q969K7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM54Q969K7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM54Q969K7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM54Q969K7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM54Q969K7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM54Q969K7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM54Q969K7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM54Q969K7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM54Q969K7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM54Q969K7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM54Q969K7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM54Q969K7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM54Q969K7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM54Q969K7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM54Q969K7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM54Q969K7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM54Q969K7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM54Q969K7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM54Q969K7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM54Q969K7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM54Q969K7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM54Q969K7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM54Q969K7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM54Q969K7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM54Q969K7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM54Q969K7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEM54Q969K7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEM54Q969K7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEM54Q969K7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM54Q969K7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM54Q969K7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM54Q969K7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM54Q969K7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM54Q969K7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM54Q969K7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM54Q969K7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM54Q969K7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM54Q969K7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM54Q969K7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM54Q969K7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM54Q969K7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM54Q969K7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM54Q969K7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM54Q969K7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM54Q969K7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM54Q969K7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM54Q969K7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM54Q969K7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM54Q969K7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM54Q969K7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM54Q969K7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM54Q969K7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM54Q969K7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM54Q969K7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM54Q969K7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM54Q969K7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM54Q969K7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM54Q969K7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM54Q969K7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms