Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BHMTQ93088 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
BHMTQ93088 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BHMTQ93088 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
BHMTQ93088 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
BHMTQ93088 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BHMTQ93088 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BHMTQ93088 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
BHMTQ93088 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BHMTQ93088 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BHMTQ93088 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BHMTQ93088 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BHMTQ93088 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BHMTQ93088 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BHMTQ93088 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BHMTQ93088 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BHMTQ93088 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BHMTQ93088 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BHMTQ93088 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BHMTQ93088 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BHMTQ93088 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BHMTQ93088 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BHMTQ93088 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BHMTQ93088 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BHMTQ93088 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BHMTQ93088 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BHMTQ93088 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BHMTQ93088 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BHMTQ93088 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BHMTQ93088 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BHMTQ93088 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BHMTQ93088 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BHMTQ93088 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BHMTQ93088 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BHMTQ93088 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BHMTQ93088 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BHMTQ93088 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BHMTQ93088 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BHMTQ93088 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BHMTQ93088 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BHMTQ93088 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BHMTQ93088 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BHMTQ93088 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BHMTQ93088 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BHMTQ93088 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BHMTQ93088 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BHMTQ93088 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BHMTQ93088 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BHMTQ93088 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BHMTQ93088 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BHMTQ93088 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BHMTQ93088 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
BHMTQ93088 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BHMTQ93088 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BHMTQ93088 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BHMTQ93088 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BHMTQ93088 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BHMTQ93088 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BHMTQ93088 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BHMTQ93088 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BHMTQ93088 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BHMTQ93088 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BHMTQ93088 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BHMTQ93088 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BHMTQ93088 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BHMTQ93088 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BHMTQ93088 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BHMTQ93088 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
BHMTQ93088 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BHMTQ93088 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BHMTQ93088 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BHMTQ93088 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BHMTQ93088 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BHMTQ93088 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
BHMTQ93088 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BHMTQ93088 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BHMTQ93088 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BHMTQ93088 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BHMTQ93088 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BHMTQ93088 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
BHMTQ93088 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BHMTQ93088 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BHMTQ93088 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BHMTQ93088 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
BHMTQ93088 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BHMTQ93088 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BHMTQ93088 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BHMTQ93088 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BHMTQ93088 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BHMTQ93088 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BHMTQ93088 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BHMTQ93088 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BHMTQ93088 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BHMTQ93088 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BHMTQ93088 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BHMTQ93088 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BHMTQ93088 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BHMTQ93088 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BHMTQ93088 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BHMTQ93088 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms