Protein–RNA interactions for Protein: Q93050

ATP6V0A1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V0A1Q93050 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP6V0A1Q93050 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP6V0A1Q93050 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP6V0A1Q93050 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP6V0A1Q93050 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP6V0A1Q93050 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP6V0A1Q93050 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP6V0A1Q93050 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP6V0A1Q93050 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP6V0A1Q93050 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP6V0A1Q93050 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP6V0A1Q93050 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP6V0A1Q93050 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP6V0A1Q93050 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP6V0A1Q93050 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP6V0A1Q93050 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP6V0A1Q93050 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP6V0A1Q93050 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP6V0A1Q93050 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP6V0A1Q93050 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP6V0A1Q93050 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP6V0A1Q93050 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP6V0A1Q93050 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP6V0A1Q93050 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP6V0A1Q93050 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP6V0A1Q93050 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP6V0A1Q93050 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP6V0A1Q93050 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP6V0A1Q93050 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP6V0A1Q93050 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP6V0A1Q93050 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP6V0A1Q93050 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP6V0A1Q93050 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP6V0A1Q93050 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP6V0A1Q93050 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP6V0A1Q93050 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP6V0A1Q93050 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP6V0A1Q93050 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP6V0A1Q93050 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP6V0A1Q93050 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP6V0A1Q93050 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP6V0A1Q93050 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP6V0A1Q93050 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
ATP6V0A1Q93050 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ATP6V0A1Q93050 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP6V0A1Q93050 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ATP6V0A1Q93050 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
ATP6V0A1Q93050 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP6V0A1Q93050 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP6V0A1Q93050 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ATP6V0A1Q93050 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ATP6V0A1Q93050 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP6V0A1Q93050 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP6V0A1Q93050 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATP6V0A1Q93050 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ATP6V0A1Q93050 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATP6V0A1Q93050 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ATP6V0A1Q93050 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP6V0A1Q93050 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP6V0A1Q93050 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP6V0A1Q93050 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP6V0A1Q93050 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP6V0A1Q93050 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP6V0A1Q93050 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP6V0A1Q93050 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP6V0A1Q93050 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP6V0A1Q93050 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP6V0A1Q93050 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ATP6V0A1Q93050 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ATP6V0A1Q93050 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ATP6V0A1Q93050 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
ATP6V0A1Q93050 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP6V0A1Q93050 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP6V0A1Q93050 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP6V0A1Q93050 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP6V0A1Q93050 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP6V0A1Q93050 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP6V0A1Q93050 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP6V0A1Q93050 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP6V0A1Q93050 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP6V0A1Q93050 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP6V0A1Q93050 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP6V0A1Q93050 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP6V0A1Q93050 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP6V0A1Q93050 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP6V0A1Q93050 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP6V0A1Q93050 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP6V0A1Q93050 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP6V0A1Q93050 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP6V0A1Q93050 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP6V0A1Q93050 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP6V0A1Q93050 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP6V0A1Q93050 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP6V0A1Q93050 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP6V0A1Q93050 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP6V0A1Q93050 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP6V0A1Q93050 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP6V0A1Q93050 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ATP6V0A1Q93050 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP6V0A1Q93050 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms